文件名称：脉冲间隔编码matlab代码-ReceptorNetworks:用于模拟受体网络动力学的MATLAB代码
文件大小：10.38MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 04:59:38
系统开源
脉冲间隔编码受体网络 用于模拟受体网络动力学的MATLAB代码 开发了MATLAB库以产生论文结果 。 以及之前的版本 。 要求 该代码已在Windows和macOS上使用旧版本的MATLAB（至少R2015b（8.6））和最新版本（R2019b（9.7））成功进行了测试。 使用框架 良好的起点是运行图形生成或电影生成脚本，因为它们可以再现主要结果和模拟。 在每个图形类中，子图形图都是通过单独的函数生成的。 通常，对于运行定制模型的仿真，需要首先对其进行定义，类似于定义其他模型的方式（标签，df_model函数等）。 实验类型也是如此（脉冲，持续，逐步增加/减少等）。 然后，将两个对象组合到一个可以运行确定性/随机模拟并绘制结果的model_simulation对象中。 样例代码： model = models.simple_dnf_model; % create model object model.par.g1 = 2.957 ; % set regime of operation by setting the parameter(s); in this case the crit
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ReceptorNetworks-master
----README.md(3KB)
----figure2.m(5KB)
----+experiments()
--------simple_convergence_experiment.m(571B)
--------multistep_experiment.m(2KB)
--------stream_pulse_experiment.m(2KB)
--------experiment.m(2KB)
--------multi_pulse_experiment.m(2KB)
----movies_EV.m(2KB)
----plot_xpp.m(8KB)
----LICENSE(1KB)
----plotting.m(3KB)
----figure3.m(10KB)
----model_simulation.m(12KB)
----figureEV1.m(8KB)
----abs_mini.m(705B)
----agent_based_simulation.m(14KB)
----abs_animation.m(22KB)
----+utils()
--------expandable_array.m(2KB)
--------geometric_network.m(8KB)
--------util_methods.m(635B)
----quasi_potential_landscape.m(20KB)
----+models()
--------agent_based_model.m(3KB)
--------model_2comp.m(5KB)
--------simple_dnf_model.m(3KB)
--------exponential_decay_model.m(876B)
--------model.m(10KB)
----data()
--------active_patches.mat(1KB)
--------bifurcation_over_LRa_with_gamma_dnf=4.3.dat(14KB)
--------quasi_potential_landscape()
--------Ra_Pdnfa_xpp_model.ode(2KB)
--------bifurcation_over_LRa_with_gamma_dnf=2.5.dat(16KB)
--------active_fractions.mat(26KB)
--------bifurcation_over_LRa_with_gamma_dnf=2.957.dat(16KB)
--------bifurcation_over_LRa_with_gamma_dnf=3.5.dat(15KB)
--------agent_based_simulations()
--------bifurcation_over_gamma_dnf_with_LRa=0.dat(64KB)
--------active_betas.mat(37KB)
--------bifurcation_over_gamma_dnf_with_LRa=0.15.dat(31KB)
--------bifurcation_LRa_vs_gamma_dnf.dat(33KB)
----figure1.m(3KB)
----figure5.m(2KB)
----+external_tools()
--------intersections.m(11KB)
--------plotboxpos.m(4KB)