文件名称：ZEAL_commandLine：ZEAL的命令行界面
文件大小：45.27MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-01 14:27:45
structural-biology protein-structure structural-bioinformatics zernike-polynomials 3d-shape-matching
本手册介绍了如何在MATLAB中使用ZEAL的命令行版本，可从github链接XXXX下载该版本。 有关方法本身的详细信息，请参见出版物： F. Ljung and I. André, ZEAL: Protein structure alignment based on shape similarity, *Bioinformatics* XX (2020) 目录 要求 ZEAL取决于以下类别 PDB.m处理读取/获取/解析PDB文件 molShape.m从PDB对象数据生成分子形状函数（默认情况下为分子表面） ZC.m处理Zernike-Canterakis矩的计算和形状重构 ChiCoeffs.m处理.mat文件中预先计算的（与对象无关）Chi系数的加载 工具箱 ZEAL使用这些工具箱中必须安装的功能（如果ZEAL作为独立程序则包含在） gads_toolbox全球
【文件预览】：
ZEAL_commandLine-main
----ZC.m(67KB)
----molShape.m(32KB)
----graphicalAbstract_web.png(1.05MB)
----sample_data()
--------fileList_singleMode.csv(472B)
--------2ho1.pdb(354KB)
--------5mok.pdb(1.15MB)
--------fileList_alignMode.csv(207B)
--------5mok.cif(1.26MB)
--------lowTMset()
--------highTMset()
--------fileList_singleMode.txt(472B)
----ChiCoeffs.m(2KB)
----ZEALtest.m(8KB)
----README.md(18KB)
----PDB.m(35KB)
----ZEALbatch.m(21KB)
----chi_coefficients()
--------chiCoeffs_order_1.mat(1KB)
--------chiCoeffs_order_19.mat(1.36MB)
--------chiCoeffs_order_18.mat(1000KB)
--------chiCoeffs_order_5.mat(5KB)
--------chiCoeffs_order_25.mat(8.17MB)
--------chiCoeffs_order_15.mat(351KB)
--------chiCoeffs_order_6.mat(8KB)
--------chiCoeffs_order_8.mat(21KB)
--------chiCoeffs_order_4.mat(3KB)
--------chiCoeffs_order_10.mat(48KB)
--------chiCoeffs_order_13.mat(169KB)
--------chiCoeffs_order_12.mat(114KB)
--------chiCoeffs_order_16.mat(506KB)
--------chiCoeffs_order_11.mat(76KB)
--------chiCoeffs_order_20.mat(1.84MB)
--------chiCoeffs_order_17.mat(716KB)
--------chiCoeffs_order_30.mat(31.02MB)
--------chiCoeffs_order_2.mat(1KB)
--------chiCoeffs_order_7.mat(13KB)
--------chiCoeffs_order_3.mat(2KB)
--------chiCoeffs_order_14.mat(248KB)
--------chiCoeffs_order_9.mat(32KB)
----ZEAL.m(55KB)