synteny:程序同步代码

时间:2024-07-31 05:55:33
【文件属性】:

文件名称:synteny:程序同步代码

文件大小:1MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-31 05:55:33

UnrealScript

##synteny synteny 是一个程序,它根据程序生成的聚类文件重建基因组结构。 程序的输出由两个文件组成,它们以文本格式描述同线性,可以在 Excel 中查看,也可以以 .dot 格式查看。 运行同步 为了运行synteny,你需要 使用 usearch 对蛋白质进行聚类。 我们使用带有参数 -evalue 0.0001 -maxhits 1 -ublast -blast6out 的 usearch64。 运行同步 要运行 Synteny,请使用以下命令: $ /code/find-synteny.pl 您可以通过不带参数运行此命令来获取 Synteny 所采用的参数的描述: $ code/find-synteny.pl Usage: /home/itaish/software/GitHub/synteny/cod


网友评论