文件名称：PTM-X:一种预测翻译后修饰串扰的软件-开源
文件大小：159.77MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 13:48:40
开源软件
PTM-X（PTM 串扰）项目是一个免费提供的生物信息学软件平台，允许计算 PTM 对的特征和串扰对的后验概率。 预测模型是一个朴素的 Bayse 分类器，它集成了五个特征：蛋白质序列距离、三级结构距离、无序区域共定位、残基共进化和修饰共进化。 http://bioinfo.bjmu.edu.cn/ptm-x/ 也提供了一个在线工具。
【文件预览】：
eggNOG4
----mart_export.txt(1.96MB)
----veNOG_Ensembl_Uniprot.txt(624KB)
----veNOG.raw_algs.tar.gz(127.61MB)
co-occur
----PTM_coocurrence_data.txt(14.43MB)
PTMsites
----PTMsites_rat.txt(2.66MB)
----PTM_data_3species.txt(32.33MB)
----PTMsites_mouse.txt(8.08MB)
----PTMsites_human.txt(19.83MB)
----phosphosite()
--------Phosphorylation_site_dataset(28.32MB)
--------O-GalNAc_site_dataset(167KB)
--------Sumoylation_site_dataset(672KB)
--------Methylation_site_dataset(1.54MB)
--------Ubiquitination_site_dataset(7.27MB)
--------O-GlcNAc_site_dataset(147KB)
--------Acetylation_site_dataset(3.67MB)