APA-Scan:检测和可视化带注释的和潜在的替代聚腺苷酸化事件

时间:2024-04-21 23:30:44
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文件名称:APA-Scan:检测和可视化带注释的和潜在的替代聚腺苷酸化事件

文件大小:346KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-21 23:30:44

Python

APA扫描 APA-Scan在两种不同的生物学条件下检测基因下游3'-UTR中潜在的替代性聚腺苷酸化(APA)事件。 安装 APA-Scan是一个python工具,可以直接从github下载。 必须在用户计算机上安装Python(3.0或更高版本)才能运行APA-Scan。 它可以在Windows,Linux和Mac平台上运行。 用户需要运行特定文件APA-scan.py来演示APA事件。 $ python3 APA-scan.py 要为任何选定的3'-UTR区域生成图,用户需要运行makePlots.py并以特定模式提供输入:chromName:geneName:start-end $ python3 Make-plots.py 用户手册 可以在github 上找到APA-Scan的用户手册。 引文 请使用以下信息引用...(稍后添加) 联系作者 奈玛·艾哈迈德·法赫米(Naim


【文件预览】:
APA-Scan-master
----APA-scan.py(4KB)
----samtools(991KB)
----configuration.ini(862B)
----README.md(1012B)
----preprocess.py(674B)
----methods.py(23KB)

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