LogReg:LogReg:一种从基因表达数据中发现生物标志物的正则逻辑回归方法

时间:2024-03-07 06:04:59
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更新时间:2024-03-07 06:04:59

R

LogReg LogReg:一种从基因表达数据中发现生物标志物并与其他5种RFE方法进行比较的常规逻辑回归方法。 在Data_SPTB文件夹中,我们仅给出每个R程序输入的文件格式的示例。 输入文件仅给出前几行,但这不会影响文章的结果。 (1)“ Box_PRS.R” ----在独立数据集中获取早产风险评分(PRS)的箱线图。 (2)“ Class_ROC.R” ----通过AUC值验证独立数据集上已识别的生物标记。 (3)“ DEgene.R” ----识别数据集上的差异表达基因(DEG),并找到调整后的P值<0.05的候选对象。 (4)“ GSE59491_cel.R” ----用岭,套索,弹性网,L0,L1 / 2,SCAD和MCP等七个有效的罚分解决正则logistic回归。 (5)“ GSE59491_expr.R” ----处理GSE59491的原始数据。 (6)“


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