文件名称：光谱匹配matlab代码-Muscari:MUSCARI（多任务谱聚类算法）
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文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 03:31:45
系统开源
光谱匹配Matlab代码MUSCARI（多任务谱聚类算法） 穆斯卡里（Muscari）是一种新的基于多任务图的聚类算法，通过使用物种与物种之间的系统发育关系，共同从物种特定的全基因组共表达网络中跨物种识别基因共表达模块（或子网络）。共表达矩阵的基于图的性质。 穆斯卡里（Muscari）基于Arboretum-HiC（）多任务图聚类算法，该算法将每个任务定义为一个光谱图聚类问题，每个物种一个，多任务学习框架同时搜索相互作用的基因组同时考虑了物种之间的系统发育关系。 与植物园HiC不同，穆斯卡里输入是基因表达矩阵，该矩阵转换为完全连接的加权基因共表达网络。 安装 1.所需环境 matlab（R2006a或更高版本）：仅对于生成特征向量矩阵是必需的 2.下载代码 code / ：穆斯卡里编码目录 run_muscari.sh ：穆斯卡里的包装程序运行脚本。 该脚本需要其他两个后续脚本： eigvecmat_calc.m：特征向量矩阵计算脚本 run_eigvecmat_calculation.m：用于运行eigvecmat_calc.m的包装器脚本 3.编写穆斯卡里代码 运行代码/ Make