本文参考：http://shannonstrutz.com/uncategorized/setting-up-usbasp-for-use-with-atmel-studio-6
很多教程中都提供使用Atmel Studio和MKII对AVR单片机进行烧写，但民间使用最多的烧写器是物美价廉的USBasp，10元左右的价格比200元的MKII亲民多了。但是在Atmel Studio中不可以直接使用USBasp进行烧写，于是通常需要借助其他软件，带来更多麻烦。
本文通过Atmel Studio的External Tools和Avrdude软件，达到可以在Atmel Studio中直接烧写单片机的目的。这样可以在开发环境中完成编程、编译和烧写，非常方便。
第一步：你需要有一个USBasp以及其驱动，驱动程序在网络上铺天盖地，在购买模块的时候向店家索要也可。在设备管理器中可以通过设定驱动搜索的路径来安装驱动。驱动安装完成之后设备管理器中会出现libusb-win32 device，点开隐藏后有USBasp设备。如图所示。
第二步：安装好驱动后，需要安装Avrdude软件。下载页面在此：http://download.savannah.gnu.org/releases/avrdude/
windows系统可以选择下载zip格式的文件，解压之后是两个文件，一个可执行文件和一个配置文件，放在想要的目录下（需要放在一个目录下）。这两个文件的路径尽量不变，否则需要重新配置第三步。
第三步：打开Atmel Studio软件，点击Tools菜单，选择Externel Tools。首先在界面下方几个文本框中进行配置。Title随意，我写的是USBasp。Command输入框内输入 (路径/)(avrdude软件名）.exe，如如果放在D盘根目录下，可执行文件的名字是avrdude.exe，则输入D:\avrdude.exe。Argument输入框输入：
-c usbasp -p atmega16 -B12 -U flash:w:$(ProjectDir)Debug\$(TargetName).hex:i
注：参考的原文中对应上述指令最后的TargetName，用的是ItemFileName，这样的话必须.c程序文件名和.hex文件名相同。如果你的.c文件名是main.c，则会报错。
另外，上述命令的-p参数是单片机型号，我使用的是atmega16，需要改成你的型号。
设置好之后点击Add按钮，就设置好了。之后Tools菜单下就会有你设置好的Title 的选项。如下图。
出现了USBasp选项。写完程序后，必需先按F7编译解决方案，再点击这个选项。之后会出现Avrdude的命令行界面，会出现几个进度条。如果只出现一个进度条，命令行界面一闪而过，则可能是编译失败了，我的方法是在点击 的瞬间截图，看报的错误是什么。也可以直接用CMD命令行运行Avrdude，烧写.hex文件，看看报的错误。
另外，如果是新单片机没有设置过熔丝位的话，需要先设置熔丝位，否则单片机会默认使用1MHz的内部时钟。熔丝位只需设置一次，所以可以使用任何软件设置一次便一劳永逸。如果没有熔丝位设置软件，也可以用上文Avrdude来设置。使用命令行，先导航到avrdude.exe所在目录，然后执行指令。以我的为例，使用atmega16芯片，设置LFuse，使单片机使用外部晶振：
avrdude -c usbasp -p atmega16 -U lfuse:w:0xCE:m
熔丝位的计算可以使用熔丝位计算器：http://www.engbedded.com/fusecalc/
可能出现的问题：
1.原文提到说参数命令行中的路径可能出现问题，解决方案是将两个双引号去掉。
2.如果命令行中提示找不到usbasp的问题，则检查驱动，或者重新安装别的驱动程序试试。