VS 2005/VS 2008在生成可执行文件时使用了一种新的技术，该技术生成的可执行文件会伴随生成一个清单文件（manifest file）（.manifest后缀文件）（其本质上是XML文档，你可以用文本编辑器打开看看），并在链接完成后将该清单文件嵌入到exe文件中（默认情况下）。而在FAT32文件系统中，在处理清单文件阶段，当增量链接时不能完成清单文件的更新（默认情况下），于是造成清单文件嵌入失败，从而使该exe文件运行时没有相应的清单文件而运行失败并提示如上错误。
解决方案很多，列举如下：
1. 由于这是在链接动态运行库出现的问题，所以你可以选择代码生成的连接方式为 /MTd 而非 /MDd ，不用这些DLL文件从而避免问题的出现。该方法有一个很显然的缺点：适用范围有限，不推荐该方法。
注：/MT /MTD MD /MDD 之间的关系可以参见 VC运行库版本不同导致链接.LIB静态库时发生重复定义问题的一个案例分析和总结；另外如果使用/MT 或者/MTD 那么生成的文件的尺寸基本上是使用/MD 或者/MDD的10倍大小
2. 既然跟FAT32系统有关，那么我们可以选择在NTFS文件系统中开发从而避免该问题，此方法同上，也是采用的回避问题的方式，不提倡。（我个人推荐使用这种方法）
3. 该方法仍与FAT32有关：在项目的“属性｜配置属性｜清单工具｜常规(Project | Game Properties | Configuration Properties | C/C++ | Code Generation | Runtime Library)”中的“使用FAT32解决办法”选择“是”（默认为“否”），重新生成项目即可解决问题。该方法是唯一真正针对问题所在而提出的解决方法，使清单工具可以正确更新。（此方法是官方解决方法，也比较方便，推荐）
4. 既然问题是在更新嵌入的清单文件时发生的，由于FAT32的原因而未能更新嵌入的清单文件，于是我们有如下两种解决方法：
（1）不启用增量链接。在项目的“属性｜配置属性｜链接器｜常规”中的“启用增量链接”选择“否”。此方法阻断了问题产生的源头，其每次生成exe文件时都直接嵌入清单文件，而不是默认的根据时戳而决定是否更新清单文件。
（2）不嵌入清单文件。在项目的“属性｜配置属性｜清单工具｜输入和输出”中的“嵌入清单”选择“否”，从而在生成exe文件时附随生成一个清单文件（默认情况下，其文件名为exe文件的全名加上“.manifest”），避免了嵌入清单文件可能失败的问题。在程序运行时，会用到该清单文件。显然，这种方式使可执行程序产生了更多的外部依赖，不推荐。
另外，还有一个不能称为方法的土办法：每次Build前手动删除*.ilk文件（增量链接文件）（当然可以在项目属性中写入删除命令，使其自动执行），不推荐该土办法。
最后，总结一下：
1. 此问题只在特定条件下才会出现：在FAT32文件系统中编译、默认设置（增量模式、不启用FAT32解决方案、嵌入清单文件）、非第一次生成可执行文件文件（即在增量连接、更新清单文件时）。（注意）
2. 解决方案1和4.1方便实用，推荐使用。
ps：我个人认为解决这个问题的最好方法就是使用vc2005/vc2008的时候，在ntfs文件系统上进行开发（也就是第2种方法）。当前的绝大多数软件在ntfs文件系统都能够正常的运行（即便是dos类的工具也能在ntfs文件系统上良好的运行），为什么还要死抱着fat/fat32文件系统不放呢？
另外要注意一个概念问题，“VC2008下提示找不到MSVCP90D.dll”这是属于开发问题，是由于windows文件系统的bug（fat32的bug），导致vc2005/vc2008开发工具编译出来的程序不能正常的运行。
来源http://alone-dancer-sohu-com.javaeye.com/blog/418743
我用第三种方法解决了。