首先一个思维导图来看下Tomcat的类加载机制和JVM类加载机制的过程
类加载
在JVM中并不是一次性把所有的文件都加载到，而是一步一步的，按照需要来加载。
比如JVM启动时，会通过不同的类加载器加载不同的类。当用户在自己的代码中，需要某些额外的类时，再通过加载机制加载到JVM中，并且存放一段时间，便于频繁使用。
因此使用哪种类加载器、在什么位置加载类都是JVM中重要的知识。
JVM类加载
JVM类加载采用 双亲委派机制，如下图所示：
JVM中包括集中类加载器：
1 BootStrapClassLoader 引导类加载器
2 ExtClassLoader 扩展类加载器
3 AppClassLoader 应用类加载器
4 CustomClassLoader 用户自定义类加载器
他们的区别上面也都有说明。需要注意的是，不同的类加载器加载的类是不同的，因此如果用户加载器1加载的某个类，其他用户并不能够使用。
当JVM运行过程中，用户需要加载某些类时，会按照下面的步骤（父类委托机制）：
1 用户自己的类加载器，把加载请求传给父加载器，父加载器再传给其父加载器，一直到加载器树的顶层。
2 最顶层的类加载器首先针对其特定的位置加载，如果加载不到就转交给子类。
3 如果一直到底层的类加载都没有加载到，那么就会抛出异常ClassNotFoundException。
因此，按照这个过程可以想到，如果同样在CLASSPATH指定的目录中和自己工作目录中存放相同的class，会优先加载CLASSPATH目录中的文件。
Tomcat类加载
在tomcat中类的加载稍有不同，如下图：
当tomcat启动时，会创建几种类加载器：
1 Bootstrap 引导类加载器
加载JVM启动所需的类，以及标准扩展类（位于jre/lib/ext下）
2 System 系统类加载器
加载tomcat启动的类，比如bootstrap.jar，通常在catalina.bat或者catalina.sh中指定。位于CATALINA_HOME/bin下。
3 Common 通用类加载器
加载tomcat使用以及应用通用的一些类，位于CATALINA_HOME/lib下，比如servlet-api.jar
4 webapp 应用类加载器
每个应用在部署后，都会创建一个唯一的类加载器。该类加载器会加载位于 WEB-INF/lib下的jar文件中的class 和 WEB-INF/classes下的class文件。
当应用需要到某个类时，则会按照下面的顺序进行类加载：
1 使用bootstrap引导类加载器加载
2 使用system系统类加载器加载
3 使用应用类加载器在WEB-INF/classes中加载
4 使用应用类加载器在WEB-INF/lib中加载
5 使用common类加载器在CATALINA_HOME/lib中加载
问题扩展
通过对上面tomcat类加载机制的理解，就不难明白 为什么java文件放在Eclipse中的src文件夹下会优先jar包中的class?
这是因为Eclipse中的src文件夹中的文件java以及webContent中的JSP都会在tomcat启动时，被编译成class文件放在 WEB-INF/class 中。
而Eclipse外部引用的jar包，则相当于放在 WEB-INF/lib 中。
因此肯定是 java文件或者JSP文件编译出的class优先加载。
通过这样，我们就可以简单的把java文件放置在src文件夹中，通过对该java文件的修改以及调试，便于学习拥有源码java文件、却没有打包成xxx-source的jar包。
另外呢，开发者也会因为粗心而犯下面的错误。
在 CATALINA_HOME/lib 以及 WEB-INF/lib 中放置了 不同版本的jar包，此时就会导致某些情况下报加载不到类的错误。
还有如果多个应用使用同一jar包文件，当放置了多份，就可能导致 多个应用间 出现类加载不到的错误。
OSGi类加载
OSGi：灵活的类加载结构。
OSGi（Open Service Gateway Initiative）：是OSGi联盟定制的基于Java语言 的动态模块化规范。
OSGi的模块（Bundle）与普通Java区别：两者区别并不太大，都是以JAR 格式封装，并且内部存储都是Java Package和Class。但是Bundle可以声明依赖 的Java Package，也可以声明它导出发布的Java Package。Bundle从传统上层模块依 赖转变为平级模块依赖。QSGi的Bundle类加载器之间只有规则，没有固定委派关 系。
OSGi类加载器关系：
某个Bundle声明依赖的Package，如果有其他Bundle发布了此Package，则对这个 个package的所有类加载动作会委派它的Bundle了类加载器去完成。
例如：
BundleA：声明发布PackageA，依赖java.*的包；
BundleB：声明依赖PackageA和PackageC，也同时依赖java.*；
BundleC：声明发布PackageC，同时声明依赖PackageA。
则关系图如下：
OSGi类加载器分析：
可以看出，OSGi类加载器之间不再是双亲委派模型的树形结构，而是进一步发展成 为一种运行时才能确定的网状结构。这种网状类加载器结构拥有更优秀的灵活性， 同时也有许多隐患，由于各模块间依赖关系错综复杂，高并发量下容易发生死锁等 问题。
参考
【1】Tomcat Class Loader：http://tomcat.apache.org/tomcat-6.0-doc/class-loader-howto.html
【2】Tomcat 类加载机制：http://blog.csdn.net/dc_726/article/details/11873343