今天发现了这样的问题，php-fpm运行sqlcipher时，有些数据库工作正常，有些却不正常。
不正常的，都在日志上报错，也就是php处理异常了。
这个报错发生在执行sql语句时，通常就是sqlcipher实际去解密，分析数据库结构之时。
为什么其它的数据库又正常呢，反复在python和php下执行，验证并不是key的问题后。这就怪事了，同一php代码，在php下执行正常，在php-fpm（cgi for nginx）却不正常。
最后发现，不正常的数据库处理，都发生在数据库文件大于30M。通过sqlcipher解密出数据库文件，让php-fpm直接使用没有加密的数据库文件（体积在30M以上），却一切正常。
补充：
第二天，发觉不对，因为在我的开发环境中，php-fpm跑sqlcipher是一切正常的，但是放到服务器上就不能正常跑。开发机器和服务器是同样版本的linux，安装同样的包，唯一就是硬件不同。开发机是i5上虚拟机，服务器是至强cpu。都是x86_64，也不用特殊的扩展指令集。不管怎么，在服务器上重新编译php的sqlcipher扩展，结果也是不行。因为使用php去直接运行代码是跑得正常的，所以将 nginx 的 cgi 从php-fpm 转到 php-cgi，果然没有出错一切正常。xdebug也只能跟踪php代码，扩展是c层的东西，当控制流从php层进入扩展的c层就没办法了，不好调试。php-fpm是多进程的，gdb也不好命中。
sqlcipher在php-fpm下工作时，如果加密的数据库文件超过30M（临界点在多少没仔细去测） 后，就会不正常。
在使用sqlcipher_export导出解密数据库时，如果没有将解密数据库detach就退出命令行，导出的数据库仍旧是加密的。