先声明，本文不是自己原创，都是在做应用的时候涉及到的内容，但是把签名的所有内容都涉及到了。包括签名的知识点、怎么签名、安装前的签名对比是否相同。
1、签名的基础知识点:
发布过Android应用的朋友们应该都知道，Android APK的发布是需要签名的。签名机制在Android应用和框架中有着十分重要的作用。
例如，Android系统禁止更新安装签名不一致的APK；如果应用需要使用system权限，必须保证APK签名与Framework签名一致，等等。在《APK Crack》 (http://www.blogjava.net/zh-weir/archive/2011/06/11/352099.html)一文中，我们了解到，要破解一个APK，必然需要重新对APK进行签名。而这个签名，一般情况无法再与APK原先的签名保持一致。（除非APK原作者的私钥泄漏，那已经是另一个层次的软件安全问题了。）
简单地说，签名机制标明了APK的发行机构。因此，站在软件安全的角度，我们就可以通过比对APK的签名情况，判断此APK是否由“官方”发行，而不是被破解篡改过重新签名打包的“盗版软件”。
Android签名机制
为了说明APK签名比对对软件安全的有效性，我们有必要了解一下Android APK的签名机制。为了更易于大家理解，我们从Auto-Sign工具的一条批处理命令说起。
在《APK Crack》 (http://www.blogjava.net/zh-weir/archive/2011/06/11/352099.html)一文中，我们了解到，要签名一个没有签名过的APK，可以使用一个叫作Auto-sign的工具。Auto-sign工具实际运行的是一个叫做Sign.bat的批处理命令。用文本编辑器打开这个批处理文件，我们可以发现，实现签名功能的命令主要是这一行命令：
java -jar signapk.jar testkey.x509.pem testkey.pk8 update.apk update_signed.apk
这条命令的意义是：通过signapk.jar这个可执行jar包，以“testkey.x509.pem”这个公钥文件和“testkey.pk8”这个私钥文件对“update.apk”进行签名，签名后的文件保存为“update_signed.apk”。
对于此处所使用的私钥和公钥的生成方式，这里就不做进一步介绍了。这方面的资料大家可以找到很多。我们这里要讲的是signapk.jar到底做了什么。
signapk.jar是Android源码包中的一个签名工具。由于Android是个开源项目，所以，很高兴地，我们可以直接找到signapk.jar的源码！路径为/build/tools/signapk/SignApk.java。
对比一个没有签名的APK和一个签名好的APK，我们会发现，签名好的APK包中多了一个叫做META-INF的文件夹。里面有三个文件，分别名为MANIFEST.MF、CERT.SF和CERT.RSA。signapk.jar就是生成了这几个文件（其他文件没有任何改变。因此我们可以很容易去掉原有签名信息）。
通过阅读signapk源码，我们可以理清签名APK包的整个过程。
1、 生成MANIFEST.MF文件：
程序遍历update.apk包中的所有文件(entry)，对非文件夹非签名文件的文件，逐个生成SHA1的数字签名信息，再用Base64进行编码。具体代码见这个方法：
private static Manifest addDigestsToManifest(JarFile jar)
关键代码如下：
for (JarEntry entry: byName.values()) {
String name = entry.getName();
if (!entry.isDirectory() && !name.equals(JarFile.MANIFEST_NAME) &&
!name.equals(CERT_SF_NAME) && !name.equals(CERT_RSA_NAME) &&
(stripPattern == null ||!stripPattern.matcher(name).matches())) {
InputStream data = jar.getInputStream(entry);
while ((num = data.read(buffer)) > 0) {
md.update(buffer, 0, num);
}
Attributes attr = null;
if (input != null) attr = input.getAttributes(name);
attr = attr != null ? new Attributes(attr) : new Attributes();
attr.putValue("SHA1-Digest", base64.encode(md.digest()));
output.getEntries().put(name, attr);
}
}
之后将生成的签名写入MANIFEST.MF文件。关键代码如下：
Manifest manifest = addDigestsToManifest(inputJar);
je = new JarEntry(JarFile.MANIFEST_NAME);
je.setTime(timestamp);
outputJar.putNextEntry(je);
manifest.write(outputJar);
这里简单介绍下SHA1数字签名。简单地说，它就是一种安全哈希算法，类似于MD5算法。它把任意长度的输入，通过散列算法变成固定长度的输出（这里我们称作“摘要信息”）。你不能仅通过这个摘要信息复原原来的信息。另外，它保证不同信息的摘要信息彼此不同。因此，如果你改变了apk包中的文件，那么在apk安装校验时，改变后的文件摘要信息与MANIFEST.MF的检验信息不同，于是程序就不能成功安装。
2、生成CERT.SF文件：
对前一步生成的Manifest，使用SHA1-RSA算法，用私钥进行签名。关键代码如下：
Signature signature = Signature.getInstance("SHA1withRSA");
signature.initSign(privateKey);
je = new JarEntry(CERT_SF_NAME);
je.setTime(timestamp);
outputJar.putNextEntry(je);
writeSignatureFile(manifest,
new SignatureOutputStream(outputJar, signature));
RSA是一种非对称加密算法。用私钥通过RSA算法对摘要信息进行加密。在安装时只能使用公钥才能解密它。解密之后，将它与未加密的摘要信息进行对比，如果相符，则表明内容没有被异常修改。
3、生成CERT.RSA文件：
生成MANIFEST.MF没有使用密钥信息，生成CERT.SF文件使用了私钥文件。那么我们可以很容易猜测到，CERT.RSA文件的生成肯定和公钥相关。
CERT.RSA文件中保存了公钥、所采用的加密算法等信息。核心代码如下：
je = new JarEntry(CERT_RSA_NAME);
je.setTime(timestamp);
outputJar.putNextEntry(je);
writeSignatureBlock(signature, publicKey, outputJar);
其中writeSignatureBlock的代码如下：
private static void writeSignatureBlock(
Signature signature, X509Certificate publicKey, OutputStream out)
throws IOException, GeneralSecurityException {
SignerInfo signerInfo = new SignerInfo(
new X500Name(publicKey.getIssuerX500Principal().getName()),
publicKey.getSerialNumber(),
AlgorithmId.get("SHA1"),
AlgorithmId.get("RSA"),
signature.sign());
PKCS7 pkcs7 = new PKCS7(
new AlgorithmId[] { AlgorithmId.get("SHA1") },
new ContentInfo(ContentInfo.DATA_OID, null),
new X509Certificate[] { publicKey },
new SignerInfo[] { signerInfo });
pkcs7.encodeSignedData(out);
}
好了，分析完APK包的签名流程，我们可以清楚地意识到：
1、 Android签名机制其实是对APK包完整性和发布机构唯一性的一种校验机制。
2、 Android签名机制不能阻止APK包被修改，但修改后的再签名无法与原先的签名保持一致。（拥有私钥的情况除外）。
3、 APK包加密的公钥就打包在APK包内，且不同的私钥对应不同的公钥。换句话言之，不同的私钥签名的APK公钥也必不相同。所以我们可以根据公钥的对比，来判断私钥是否一致。
APK签名比对的实现方式
好了，通过Android签名机制的分析，我们从理论上证明了通过APK公钥的比对能判断一个APK的发布机构。并且这个发布机构是很难伪装的，我们暂时可以认为是不可伪装的。
有了理论基础后，我们就可以开始实践了。那么如何获取到APK文件的公钥信息呢？因为Android系统安装程序肯定会获取APK信息进行比对，所以我们可以通过Android源码获得一些思路和帮助。
源码中有一个隐藏的类用于APK包的解析。这个类叫PackageParser，路径为frameworks\base\core\java\android\content\pm\PackageParser.java。当我们需要获取APK包的相关信息时，可以直接使用这个类，下面代码就是一个例子函数：
private PackageInfo parsePackage(String archiveFilePath, int flags){
PackageParser packageParser = new PackageParser(archiveFilePath);
DisplayMetrics metrics = new DisplayMetrics();
metrics.setToDefaults();
final File sourceFile = new File(archiveFilePath);
PackageParser.Package pkg = packageParser.parsePackage(
sourceFile, archiveFilePath, metrics, 0);
if (pkg == null) {
return null;
}
packageParser.collectCertificates(pkg, 0);
return PackageParser.generatePackageInfo(pkg, null, flags, 0, 0);
}
其中参数archiveFilePath指定APK文件路径；flags需设置PackageManager.GET_SIGNATURES位，以保证返回证书签名信息。
具体如何通过PackageParser获取签名信息在此处不做详述，具体代码请参考PackageParser中的public boolean collectCertificates(Package pkg, int flags)和private Certificate[] loadCertificates(JarFile jarFile, JarEntry je, byte[] readBuffer)方法。至于如何在Android应用开发中使用隐藏的类及方法，可以参看我的这篇文章： 《Android应用开发中如何使用隐藏API》 (http://www.blogjava.net/zh-weir/archive/2011/05/01/349360.html) 。
紧接着，我们就可以通过packageInfo.signatures来访问到APK的签名信息。还需要说明的是 Android中Signature和Java中Certificate的对应关系。它们的关系如下面代码所示：
pkg.mSignatures = new Signature[certs.length];
for (int i=0; i<N; i++) {
pkg.mSignatures[i] = new Signature(
certs[i].getEncoded());
}
也就是说signature = new Signature(certificate.getEncoded()); certificate证书中包含了公钥和证书的其他基本信息。公钥不同，证书肯定互不相同。我们可以通过certificate的getPublicKey方法获取公钥信息。所以比对签名证书本质上就是比对公钥信息。
OK，获取到APK签名证书之后，就剩下比对了。这个简单，功能函数如下所示:
private boolean IsSignaturesSame(Signature[] s1, Signature[] s2) {
if (s1 == null) {
return false;
}
if (s2 == null) {
return false;
}
HashSet<Signature> set1 = new HashSet<Signature>();
for (Signature sig : s1) {
set1.add(sig);
}
HashSet<Signature> set2 = new HashSet<Signature>();
for (Signature sig : s2) {
set2.add(sig);
}
// Make sure s2 contains all signatures in s1.
if (set1.equals(set2)) {
return true;
}
return false;
}
APK签名比对的应用场景
经过以上的论述，想必大家已经明白签名比对的原理和我的实现方式了。那么什么时候什么情况适合使用签名对比来保障Android APK的软件安全呢？
个人认为主要有以下三种场景：
1、 程序自检测。在程序运行时，自我进行签名比对。比对样本可以存放在APK包内，也可存放于云端。缺点是程序被破解时，自检测功能同样可能遭到破坏，使其失效。
2、 可信赖的第三方检测。由可信赖的第三方程序负责APK的软件安全问题。对比样本由第三方收集，放在云端。这种方式适用于杀毒安全软件或者APP Market之类的软件下载市场。缺点是需要联网检测，在无网络情况下无法实现功能。（不可能把大量的签名数据放在移动设备本地）。
3、 系统限定安装。这就涉及到改Android系统了。限定仅能安装某些证书的APK。软件发布商需要向系统发布上申请证书。如果发现问题，能追踪到是哪个软件发布商的责任。适用于系统提供商或者终端产品生产商。缺点是过于封闭，不利于系统的开放性。
以上三种场景，虽然各有缺点，但缺点并不是不能克服的。例如，我们可以考虑程序自检测的功能用native method的方法实现等等。软件安全是一个复杂的课题，往往需要多种技术联合使用，才能更好的保障软件不被恶意破坏。
参考资料
Android源码
《Android中的签名机制》 (http://blog.csdn.net/absurd/article/details/5002763)
以上内容转自:http://www.blogjava.net/zh-weir/archive/2011/07/19/354663.html
另附上其他的资料：
2 String PATH_PackageParser = "android.content.pm.PackageParser";
3 try {
4 // apk包的文件路径
5 // 这是一个Package 解释器, 是隐藏的
6 // 构造函数的参数只有一个, apk文件的路径
7 // PackageParser packageParser = new PackageParser(apkPath);
8 Class pkgParserCls = Class.forName(PATH_PackageParser);
9 Class[] typeArgs = new Class[1];
10 typeArgs[0] = String. class;
11 Constructor pkgParserCt = pkgParserCls.getConstructor(typeArgs);
12 Object[] valueArgs = new Object[1];
13 valueArgs[0] = apkPath;
14 Object pkgParser = pkgParserCt.newInstance(valueArgs);
15 MediaApplication.logD(DownloadApk. class, "pkgParser:" + pkgParser.toString());
16 // 这个是与显示有关的, 里面涉及到一些像素显示等等, 我们使用默认的情况
17 DisplayMetrics metrics = new DisplayMetrics();
18 metrics.setToDefaults();
19 // PackageParser.Package mPkgInfo = packageParser.parsePackage(new
20 // File(apkPath), apkPath,
21 // metrics, 0);
22 typeArgs = new Class[4];
23 typeArgs[0] = File. class;
24 typeArgs[1] = String. class;
25 typeArgs[2] = DisplayMetrics. class;
26 typeArgs[3] = Integer.TYPE;
27 Method pkgParser_parsePackageMtd = pkgParserCls.getDeclaredMethod("parsePackage",
28 typeArgs);
29 valueArgs = new Object[4];
30 valueArgs[0] = new File(apkPath);
31 valueArgs[1] = apkPath;
32 valueArgs[2] = metrics;
33 valueArgs[3] = PackageManager.GET_SIGNATURES;
34 Object pkgParserPkg = pkgParser_parsePackageMtd.invoke(pkgParser, valueArgs);
35
36 typeArgs = new Class[2];
37 typeArgs[0] = pkgParserPkg.getClass();
38 typeArgs[1] = Integer.TYPE;
39 Method pkgParser_collectCertificatesMtd = pkgParserCls.getDeclaredMethod("collectCertificates",
40 typeArgs);
41 valueArgs = new Object[2];
42 valueArgs[0] = pkgParserPkg;
43 valueArgs[1] = PackageManager.GET_SIGNATURES;
44 pkgParser_collectCertificatesMtd.invoke(pkgParser, valueArgs);
45 // 应用程序信息包, 这个公开的, 不过有些函数, 变量没公开
46 Field packageInfoFld = pkgParserPkg.getClass().getDeclaredField("mSignatures");
47 Signature[] info = (Signature[]) packageInfoFld.get(pkgParserPkg);
48 MediaApplication.logD(DownloadApk. class, "size:"+info.length);
49 MediaApplication.logD(DownloadApk. class, info[0].toCharsString());
50 return info[0].toCharsString();
51 } catch (Exception e) {
52 e.printStackTrace();
53 }
54 return null;
55 }
获取程序自身的签名：
PackageManager pm = context.getPackageManager();
List<PackageInfo> apps = pm.getInstalledPackages(PackageManager.GET_SIGNATURES);
Iterator<PackageInfo> iter = apps.iterator();
while(iter.hasNext()) {
PackageInfo packageinfo = iter.next();
String packageName = packageinfo.packageName;
if (packageName.equals(instance.getPackageName())) {
MediaApplication.logD(DownloadApk.class, packageinfo.signatures[0].toCharsString());
return packageinfo.signatures[0].toCharsString();
}
}
return null;
}
对比2个方法的返回值来判断APK升级包的签名是否一致，一致就提示可以安装。
以上转自： http://www.cnblogs.com/tt_mc/还有签名命令：
命令：
生成keystone（存放一组证书和私钥的地方）
keytool -genkey -alias（别名） hello -keyalg RSA -validity 20000 -keystore hello.keystore
查看keystore 信息
keytool -list -v -keystore hello.keystore -storepass 123456
缺省情况下，-list 命令打印证书的 MD5 指纹。而如果指定了 -v 选项，将以可读格式打印证书，如果指定了 -rfc 选项，将以可打印的编码格式输出证书。
keytool -list -rfc -keystore hello.keystore -storepass 123456
证书的导出：
keytool -export -alias test -keystore hello.keystore -file test.crt -storepass 123456
证书的导入
keytool -import -alias rootcert -file root.crt -keystore hello.keystore
证书条目的删除：
keytool -delete -alias ceatecert1 -keystore .keystore -storepass 123456
使用jdk的jarsigner工具对apk文件签名
jarsigner -verbose -keystore hello.keystore TestApk.apk test
签名后可以使用如下命令验证是否签名成功：
jarsigner -verify to_sign.apk
如果需要查看更详细的验证信息，可修改为：
jarsigner -certs -verbose -verify to_sign.apk
以上转自：http://yelwen000.iteye.com/blog/1207409（这里也有获取签名的代码，但是PackageParser 是android 隐藏的API ，所以我附上了上面的通过反射获取签名的代码。）
这几篇 文章讲的不错 ，再次感谢你们！