出处原文： 1分钟了解MyISAM与InnoDB的索引差异
数据库的索引分为主键索引（Primary Inkex）与普通索引（Secondary Index）。InnoDB和MyISAM是怎么利用B 树来实现这两类索引，其又有什么差异呢？这是今天要聊的内容。
一，MyISAM的索引
MyISAM的索引与行记录是分开存储的，叫做非聚集索引（UnClustered Index）。
其主键索引与普通索引没有本质差异：
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有连续聚集的区域单独存储行记录
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主键索引的叶子节点，存储主键，与对应行记录的指针
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普通索引的叶子结点，存储索引列，与对应行记录的指针
画外音：MyISAM的表可以没有主键。
主键索引与普通索引是两棵独立的索引B 树，通过索引列查找时，先定位到B 树的叶子节点，再通过指针定位到行记录。
举个例子，MyISAM：
t(id PK, name KEY, sex, flag);
表中有四条记录：
1, shenjian, m, A
3, zhangsan, m, A
5, lisi, m, A
9, wangwu, f, B
其B 树索引构造如上图：
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行记录单独存储
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id为PK，有一棵id的索引树，叶子指向行记录
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name为KEY，有一棵name的索引树，叶子也指向行记录
二、InnoDB的索引
InnoDB的主键索引与行记录是存储在一起的，故叫做聚集索引（Clustered Index）：
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没有单独区域存储行记录
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主键索引的叶子节点，存储主键，与对应行记录（而不是指针）
画外音：因此，InnoDB的PK查询是非常快的。
因为这个特性，InnoDB的表必须要有聚集索引：
(1)如果表定义了PK，则PK就是聚集索引；
(2)如果表没有定义PK，则第一个非空unique列是聚集索引；
(3)否则，InnoDB会创建一个隐藏的row-id作为聚集索引；
聚集索引，也只能够有一个，因为数据行在物理磁盘上只能有一份聚集存储。
InnoDB的普通索引可以有多个，它与聚集索引是不同的：
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普通索引的叶子节点，存储主键（也不是指针）
对于InnoDB表，这里的启示是：
(1)不建议使用较长的列做主键，例如char(64)，因为所有的普通索引都会存储主键，会导致普通索引过于庞大；
(2)建议使用趋势递增的key做主键，由于数据行与索引一体，这样不至于插入记录时，有大量索引分裂，行记录移动；
仍是上面的例子，只是存储引擎换成InnoDB：
t(id PK, name KEY, sex, flag);
表中还是四条记录：
1, shenjian, m, A
3, zhangsan, m, A
5, lisi, m, A
9, wangwu, f, B
其B 树索引构造如上图：
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id为PK，行记录和id索引树存储在一起
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name为KEY，有一棵name的索引树，叶子存储id
当：
select * from t where name=‘lisi’;
会先通过name辅助索引定位到B 树的叶子节点得到id=5，再通过聚集索引定位到行记录。
画外音：所以，其实扫了2遍索引树。
三，总结
MyISAM和InnoDB都使用B 树来实现索引：
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MyISAM的索引与数据分开存储
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MyISAM的索引叶子存储指针，主键索引与普通索引无太大区别
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InnoDB的聚集索引和数据行统一存储
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InnoDB的聚集索引存储数据行本身，普通索引存储主键
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InnoDB一定有且只有一个聚集索引
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InnoDB建议使用趋势递增整数作为PK，而不宜使用较长的列作为PK