最长公共子序列(LCS)

时间:2022-09-10 08:18:38
参考:
http://blog.chinaunix.net/uid-26548237-id-3374211.html
http://www.ahathinking.com/archives/115.html
http://blog.csdn.net/v_july_v/article/details/6695482
最长公共子串(Longest Common Substirng)和最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)的区别为:子串是串的一个连续的部分,子序列则是从不改变序列的顺序,而从序列中去掉任意的元素而获得新的序列;也就是说,子串中字符的位置必须是连续的,子序列则可以不必连续。
<pre name="code" class="cpp">//只能打印一个最长公共子序列
#include <iostream>
using namespace std;

const int X = 100, Y = 100; //串的最大长度
char result[X+1]; //用于保存结果
int count=0; //用于保存公共最长公共子序列的个数

/*功能:计算最优值
*参数:
* x:字符串x
* y:字符串y
* b:标志数组
* xlen:字符串x的长度
* ylen:字符串y的长度
*返回值:最长公共子序列的长度
*
*/
int Lcs_Length(string x, string y, int b[][Y+1],int xlen,int ylen)
{
int i = 0;
int j = 0;

int c[X+1][Y+1];//为什么矩阵c行数为X+1,列数为Y+1,就是为了避免讨论边界情况
for (i = 0; i<=xlen; i++)
{
c[i][0]=0;
}
for (i = 0; i <= ylen; i++ )
{
c[0][i]=0;
}
for (i = 1; i <= xlen; i++) //这里i,j从1开始取就避免了讨论边界的特殊情况
{

for (j = 1; j <= ylen; j++)
{
if (x[i - 1] == y[j - 1])
{
c[i][j] = c[i-1][j-1]+1;
b[i][j] = 1;//1标记按对角线移动
}
else if (c[i-1][j] > c[i][j-1])
{
c[i][j] = c[i-1][j];
b[i][j] = 2;//标记向上移动
}
else
{
c[i][j] = c[i][j-1];
b[i][j] = 3;//标记向左移动
}

}
}
cout << "计算最优值效果图如下所示:" << endl;
for(i = 1; i <= xlen; i++)
{
for(j = 1; j <= ylen; j++)
{
cout << c[i][j] << " ";
}
cout << endl;
}
return c[xlen][ylen];//返回最终计算出的最长子序列的长度
}

void Display_Lcs(int i, int j, string x, int b[][Y+1],int current_Len)
{
if (i ==0 || j==0) //这里i,j分别对应的是xlen,ylen
{
return;
}
if(b[i][j]== 1)
{
current_Len--;
result[current_Len]=x[i- 1];//把最长子序列保存到result数组中,因为是从后往前保存的所以保存到result中也是从后往前保存的
Display_Lcs(i-1, j-1, x, b, current_Len);
}
else if(b[i][j] == 2)
{
Display_Lcs(i-1, j, x, b, current_Len);
}
else

{
Display_Lcs(i, j-1, x, b, current_Len);

}
}
//也可以不用递归方法,来打印出最长子序列
void Display_Lcs2(int i,int j,string x,int b[][Y+1],int current_Len)
{
while(i&&j)//注意这里要进行i、j的边界检测
{
if(b[i][j]== 1)
{
current_Len--;
result[current_Len]=x[i- 1];//把最长子序列保存到result数组中,因为是从后往前保存的所以保存到result中也是从后往前保存的
i--;
j--;
}
else if(b[i][j] == 2)
{
i--;
}
else

{
j--;

}
}
}

int main(int argc, char* argv[])
{
string x = "ABCBDAB";
string y = "BDCABA";
int xlen = x.length();
int ylen = y.length();

int b[X + 1][Y + 1];

int lcs_max_len = Lcs_Length( x, y, b, xlen,ylen );

cout <<"最长公共子序列的长度: "<< lcs_max_len << endl;

Display_Lcs2( xlen, ylen, x, b, lcs_max_len );

//打印结果如下所示
cout<< "最长公共子序列: ";
for(int i = 0; i < lcs_max_len; i++)
{
cout <<result[i];
}
cout << endl;
return 0;
}


 
 
在LCS问题中,如果仅仅要求求出LCS的长度,而不要求输出序列,那么由于每步迭代都只用到了前面的状态,之前的信息便无用了,我们就可以使用滚动数组了
#include <iostream>
using namespace std;

/* 滚动数组 */

int dp[2][21]; //存储LCS长度,这里用两行就足够了,不停的在两行之间翻转0.

char X[21];
char Y[21];
int i, j, k;

void main()
{
cin.getline(X,20);
cin.getline(Y,20);

int xlen = strlen(X);
int ylen = strlen(Y);

for(i = 1; i <= xlen; ++i)
{
k = i & 1;//这里做位与运算,便于翻转k
for(j = 1; j <= ylen; ++j)
{
if(X[i-1] == Y[j-1])
{
dp[k][j] = dp[k^1][j-1] + 1;//k与1做异或运算调整行号,dp[k]与dp[k^1]则分别在不同行
}
else if(dp[k][j-1] > dp[k^1][j])
{
dp[k][j] = dp[k][j-1];
}else
{
dp[k][j] = dp[k^1][j];
}
}
}
printf("len of LCS is: %d\n", dp[k][ylen]);
}