.crt和.pem都是用于存储证书的格式，但它们之间存在一些重要的区别。
CRT是“Certificate”的缩写，通常是指X.509证书，这是一种包含公钥的数字证书，用于验证通过SSL或TLS加密连接传输的数据的完整性。CRT文件通常以.crt或.pem扩展名结尾。
PEM，另一方面，是“Privacy Enhanced Mail”的缩写，也是一种存储证书的格式。PEM文件通常以.pem、.key或.cer扩展名结尾。它可以存储各种类型的数据，如公钥、私钥、CA证书和证书链等，通常使用base64编码来表示二进制数据。值得注意的是，PEM文件可能包含多个CRT文件或其他类型的证书。
因此，虽然.crt和.pem都是证书格式，但PEM具有更广泛的用途，能够存储多种类型的数据，并可能包含多个证书，而CRT则更专注于存储X.509证书。在实际应用中，应根据具体需求选择合适的证书格式。