定义ROI的几种方法
- 一、使用spm中的wfupickatlas工具
- 使用方法：
- 二、使用fsl对单个被试分割
- 三、使用MarsBar进行定义ROI
一、使用spm中的wfupickatlas工具
该工具里有很多脑模板，选取ROI可以在里面选择后保存为mask。这个方法是在标准模板（MNI）下直接标记而做的，这里把wfupickatlas工具包【提取码：a6bi】放进来吧。
使用方法：
将压缩包解压后放入到spm路径下的toolbox目录里，然后在MATLAB中添加路径即可。然后在spm里的toolbox下选择wfupickatlas选择你要定义的ROI就行了。
二、使用fsl对单个被试分割
fsl里面分割roi的方法大概有fslmaths、first、fsleyes这三种方法，具体方法YouTube上都有就不详细说了。
三、使用MarsBar进行定义ROI
MarsBar工具包之前的文章里有，MarsBar与spm的wfupickatlas还是有一些区别的，这里说下主要的区别吧，MarsBar不仅可以定义sphere，box，还能设置box的设置方法。比如根据xyz的坐标范围来定（对之后壳核的分割方法有用）。