monocle 2.24.1 orderCells 函数报错问题

时间:2025-02-09 12:21:43

原函数包自身的问题罢了,解决办法也很简单:

1.下载一个2.24.0版本的: /packages/3.15/bioc/src/contrib/Archive/monocle/

2. 解压出一个monocle文件夹,里面找到/monocle/R/order_cell.R函数文件,打开编辑

3.删掉下文中的一行

if(class(projection) != 'matrix')
projection <- (projection)

改为

projection <- (projection)

保存替换原文件

4.用7-Zip软件把monocle 文件夹重新压缩,先压成.tar,再把.tar文件压成.。

studio 本地安装新包。

#还有什么问题可以参考这个帖子:

what is the "condition" in orderCells() function · Issue #434 · cole-trapnell-lab/monocle-release · GitHub