原函数包自身的问题罢了,解决办法也很简单:
1.下载一个2.24.0版本的: /packages/3.15/bioc/src/contrib/Archive/monocle/
2. 解压出一个monocle文件夹,里面找到/monocle/R/order_cell.R函数文件,打开编辑
3.删掉下文中的一行
if(class(projection) != 'matrix')
projection <- (projection)
改为
projection <- (projection)
保存替换原文件
4.用7-Zip软件把monocle 文件夹重新压缩,先压成.tar,再把.tar文件压成.。
studio 本地安装新包。
#还有什么问题可以参考这个帖子:
what is the "condition" in orderCells() function · Issue #434 · cole-trapnell-lab/monocle-release · GitHub