不是所有的Built-in材质都能自动升级到适配HDRP的shader，有需要自定义部分的shader要用Shader Graphs来修改，比如粒子shader，Built-in的Particles shader要转换为Shader Graph中的ParticleLit或ParticleUnlit系列。如不太清楚的话，可导入ShaderGraphs官方插件的Examples进行查看。
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关于Mobile shader：如需转换为URP或HDRP的话，需要先转为Standard Shader才能通过Unity自带的HDRP转换功能进行正确的转换，也许还需要重新assign一下Texture...