本系列文章旨在记录一下个人（小白）在最初学习RNA-seq的过程中遇到的一些问题，以及解决问题的坎坷之路，希望可以帮到遇到同样问题的小白们～ // 非专业，有些部分理解尚浅，留情
个人常用NCBI官方提供的sratoolkit工具/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit进行sra数据的读取、下载。个人使用的是学校实验室Linux集群，各大生信主流软件均已配备齐全，软件下载安装问题暂且略过～
测序数据准备
本文以现有网络转录组专题中的经典案例文献“AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors”为例，根据文献数据存储部分可知文章中所用RNA测序数据存储地址在GEO数据库（/geo/），ID为GSE81916
首先进入GEO数据库官网，搜索框搜索数据存储ID（GSE81916）查看数据详细属性（Overall design），可知当前ID包含存有15份数据，其中Sample 9-15为我们所需要的mRNA测序数据，因此只需下载此部分数据。
根据信息，勾选需下载的数据，输出txt文件（文件名），该文件内容实际为相关测序数据的SRR编号。
准备好SRR编号信息之后，将txt文件传输至工作路径下（个人常用第三方ftp软件传输，如Filezilla），然后便可进行数据下载
module load sratoolkit/3.0.0 #实module工具加载sra软件#prefetch工具下载单个数据时，SRR3589956为例prefeth SRR3589956 -O output #output为数据输出路径，不做更改将在当前工作路径下自动创建一个名为output的文件夹##若需要批量下载多个数据时，如本文案例需下载7个数据，运行以下代码即可prefetch -O output --option-file ##即为此前下载的SRR编号文件##等待片刻，数据就下载完成啦～以下是代码实际运行展示：
