安装R包的几种方法(汇总)

时间:2024-12-10 22:26:00

以下载ggplot包为例

        1. 在R studio界面中直接输入函数:

("ggplot") #直接输入R包的名字即可。

        2. 找不到无法下载的包,可以上Github官网搜索,上面会提供下载方法:

        3. 将包下载到本地后,进行安装:

           3.1 通过浏览器(/web/packages/ggplot2/)下载R包数据,导入到R studio中(要记住下载包的位置):

("ggplot", repos = NULL)

           3.2 通过命令行下载:

("/src/contrib/ggplot2_3.3.","ggplot2_3.3.")

如果是linux界面,可以用()来手动选择下载位置。

        4. 直接找到包的下载地址:

ggpack<-"/src/contrib/ggplot2_3.3."

(ggpack, repos=NULL, type="source")

        5.(引用)对于bioconductor的包,执行操作为:

source("/") ##安装BiocInstaller

options(BioC_mirror=”/bioc/“) 如果需要切换镜像
biocLite("ggbio")

或者直接BiocInstaller::biocLite('ggbio') ## 前提是你已经安装好了BiocInstaller

某些时候你还需要卸载("BiocInstaller") 然后安装新的

如果是3.5和以上的版本,需要使用BiocManager

("BiocManager")
BiocManager::install("",ask=F,update=F)

备注:起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options( = ‘libcurl’)就轻轻松松解决啦

        6. (引)如果是linux版本:

sudo su - -c
"R -e "('ggplot2', repos='/')""

        7. (引)进入/ ,搜索R包,最下面有下载命令。

 

conda的下载及安装操作见:conda 安装R语言及其R包 - 简书