在Matlab中调用GPU的CUDA API进行并行加速，主要有两种途径：
1）对现有Matlab代码的简单改写，调用Matlab中支持CUDA的函数进行加速。
2）将C语言的CUDA函数封装成库，在Matlab中进行调用。
前者简单方便，效率低；后者效率高，稍微麻烦。
一、matlab中直接的gpu加速计算
matlab中直接做GPU计算分为三个步骤。
（1）数据的初始化
使用gpuArray（）则可生成gpu端数据，a=gpuArray（b），即为将cpu端数据b拷贝到gpu端的a中。
（2）对GPU数据进行操作
可以使用matlab中的库函数对gpuarray直接进行操作。
（3）把GPU上的数据回传给CPU
使用gather（）则可将gpu端的数据传回cpu端。
二、 Matlab中调用CUDA C
- 配置环境
（1）Matlab环境配置：
1mex -setupC 配置编译器。注：若c语言编译器和matlab版本不匹配系统会报错：找不到编译器活SDK等。配置成功后显示下图所示信息。
2 mex -setup c++ 选择语言，在编译器配置成功后选择所需的语言。配置成功后显示如下图所示信息。
Matlab环境配置结束。
（2）系统环境变量配置
打开电脑中的高级系统设置。选择环境变量，在系统变量的Path变量中添加所安装matlab文件夹中的extern\lib\win64\microsoft，matlab\lib\win64和matlab\bin\win64。如下图所示
系统变量配置结束。
（3）VS2015环境配置：
1打开VS中得项目工程文件，对项目进行属性设置，在解决方案资源管理器中选中项目，右键选择属性进行项目属性配置。如下图所示。
2在项目得属性页中对所有配置进行一下操作。首先对VC++ 目录栏中得包含目录及库目录进行配置。在包含目录中添加所安装matlab文件夹中的extern\include和extern\include\win64,在库目录中添加extern\lib\win64\microsoft。如下图所示。(本机matlab安装于D：\matlab文件夹。)
接着配置链接器，选择常规选项栏中得附加库目录进行编辑。添加所安装的Matlab文件夹中的extern\lib\win64\microsoft.如下图所示。
最后配置链接器输入选项栏中的附加依赖项。在附加依赖项中添加：libmat.lib
、libmx.lib、libmex.lib、libeng.lib如图所示。
现VS环境配置结束。
在matlab，VS2015和系统变量成功配置后即可进行matlab与CUDA C的混合编程。
- matlab中调用.cu程序
在对matlab的配置中安装了mex文件，MEX文件是一种可在matlab环境中调用的C语言（或fortran）衍生程序。
以matlab安装目录下的mexGPUExample.cu文件为例，该文件在所安装的matlab文件夹中的toolbox\distcomp\gpu\extern\src\mex夹内,在matlab中更改路径到相应的位置。如下图所示。
首先使用mexcuda针对该mexGPUExample.cu文件，生成其mex文件。在命令行输入mexcuda mexGPUExample.cu。如下图所示。
Mex文件生成成功会有如下显示，并生成相应的mex64文件
MEX文件的调用极为方便，其调用方式与MATALAB的内建函数完全相同，只需要在命令窗口内输入对应的文件名称即可。如下图所示。
- C语言MEX程序代码文件
C语言MEX程序代码文件有计算子例程（Computational routine）和接口子程序（GatWay routine）两个相互独立的子程序组成。其中，计算子例程的功能是完成所需要的计算，它和具有相同功能的一般C源程序文件相同；接口子程序的功能则是计算子程序和MATALAB的接口，用户实现两个不同内存空间中的通信。
接口函数：mexFunction
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
nlhs：输出参数数目
plhs：指向输出参数的指针
nrhs：输入参数数目
prhs：指向输入参数的指针
- 获得输入、输出参数
输入，输出参数的获取可以用两种方式
1读取mat数据文件
将matlab中所需要的数据以mat文件形式保存。如save(‘路径’,’变量名称’)。
之后则可在程序中对该mat文件数据进行读写操作。（注：所读写的文件按每一列依次操作）。
2使用接口函数传递参数
如：[a,b]=test(c,d,e)
c,d,e为3个输入参数，a,b为两个输出参数这里的输入输出参数的指针都是指向mxArray类型。当调用test函数时会将prhs[0]=c ，prhs[1]=d ，prhs[2]=e。在c语言程序中需要使用的是mxArray指针指向的数据。因此在需要对mxArray数据进行转换。mxGetPr函数从指向mxArray类型数据的prhs[0]获得了指向double类型的指针。再通过mxGetM和mxGetN来获得输入参数的行数和列数后即可构造相应的输入矩阵。
a,b为两个输出参数。a=plhs[0], b=plhs[1]，因为输出参数的指针为指向mxArray类型，需对该数据构造相应的mxArray。
mxCreateDoubleMatrix(int m, int n, mxComplexity ComplexFlag)函数得到m*n矩阵大小的mxArray的指针，现即可放入plhs[],中传回。对输出参数的赋值与输入参数相同。
在完成了以上步骤之后即成功完成了matlab与cuda（c语言）的混合编程。