S3C2440A芯片中的时钟控制逻辑可以生成所需的时钟信号，包括用于CPU的FCLK、AHB (Advanced High-performance Bus) 总线外围设备的HCLK，以及APB (Advanced Peripheral Bus)总线外围设备的PCLK。S3C2440A有两个相锁循环（PLLs）：一个用于FCLK、HCLK和PCLK，另一个用于USB块（48 Mhz）。时钟控制逻辑可以使用无PLL的慢时钟，并且可以通过软件控制决定将时钟是否连接到外围块，这将减少芯片的功耗。
1 时钟源的选择
S3C2440A芯片的时钟来源有两个，一个是外部晶振（XTIpll 和 XTOpll）,一个来自外部时钟输入（EXTCLK），用哪一个时钟源取决于引脚 OM3和OM2。时钟源选择如下表所示：
表1.1 时钟源选择
图1.1 相关引脚的硬件连接
注：
（1）尽管MPLL在复位之后开始运行，但是MPLL输出（MPLL）不作为系统时钟使用，直到软件将有效的设置写入MPLLCON寄存器。在此有效设置之前，来自外部晶体或EXTCLK源的时钟将直接用作系统时钟。即使用户不想改变MPLLCON寄存器的默认值，用户也应该将相同的值写入MPLLCON寄存器中。
2 系统时钟框图
时钟框图说明：首先，OM[3:2]决定哪的外部时钟源作为系统时钟源，接着MPLLCONL寄存器设置P/M/S,以此得到输出时钟Mpll,CLKCNTL寄存器决定那个内部组件接入时钟，系统上电默认是接入的。 CLKDIVN寄存器决定HCLK和PCLK的频率。
3 上电时，时钟配置时序图（假设外部时钟源已经选择了晶振）
过程解析：1）上电 ，产生复位信号，等待电源稳定才输出高电平。
2）在复位信号上升沿检查M[2:3]引脚状态，并锁存。
3）在此期间，系统时钟源为外部时钟。
4）PLL适应调整自己的参数，CPU停止工作。
5）调整完毕，系统时钟配置完成。
4 如何配置系统时钟
配置顺序：1）检查引脚OM3和OM2引脚的状态
2）配置MPLLCON寄存器（0x4C000004），主要是设置M/P/S的值
官方手册给出了一个参考的配置表：（直接按照手册推荐的几个配置来，不然有可能出问题）
3）设置分频比，即配置CLKDIVN寄存器（0x4c000014）
5 实验验证
笔者所使用的开发平台为JZ2440开发板，通过编程在配置时钟源的情况下和不配置时钟源的情况下观察LED灯的闪烁速度，明显可以看到是两种不同的闪烁速度。
部分程序：
/* 设置系统时钟*/
ldr r0 ,=0x4C000004
ldr r1 ,=(92<<12)|(1<<4)|(1<<0) /*设置mPLL=400MHz*/
str r1 ,[r0]
ldr r0 ,=0x4C000014
ldr r1 ,=0x5 /*设置HCLK=100MHz，PCLK=50MHZ*/
str r1 ,[r0]