电子科大邹权组招聘博后、科研助理和访问学生（生物信息学方向）

时间：2024-04-12 16:32:31

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主编按: 我和邹权教授相识己10余年。十年前他作为我生信入门的领路人，助我硕士期间顺利发表3篇SCI而考入中科院。邹教授毕业于哈尔滨工业大学，在厦门大学和天津大学任教多年，第子遍布海内外高校和知名企业。现今邹兄加盟电子科大新建团队，正在招兵买马，机会难得，无论是考研，还是工作，都是不错的选择。

招聘启事

电子科技大学基础与前沿研究院邹权教授招聘博士后（35岁以下）、访问学生（需半年以上，研究生需征得导师同意）和科研助理（无博士学位，全职工作）。研究方向为生物信息学方向（邹老师个人主页 http://lab.malab.cn/~zq/ ）。

博士后年薪30万起步，上不封顶，支持博后出国长期交流，指导申请国家自然科学基金。

科研助理年薪10万起步，上不封顶，有五险一金。

不要求有生信基础和高水平论文，只要勤奋认真即可。

欢迎感兴趣的同学邮件联系和咨询邹老师（zouquan（at）nclab.net），署名邮件当日必回复。

实验室简介

http://lab.malab.cn/~zq/index.html

电子科大邹权组招聘博后、科研助理和访问学生（生物信息学方向）

邹权，教授，博士研究生导师，IEEE高级会员，ACM高级会员，CCF高级会员（人工智能与模式识别专业委员会委员、生物信息学专业组委员），中国人工智能学会会员（生物信息学与人工生命专委会委员、机器学习专委会委员、粗糙集专委会委员），中国运筹学会会员（计算系统生物学分会理事），中国中文信息处理学会会员，中国自动化学会会员，中国生物工程学会会员（计算生物学与生物信息学专业委员会委员）。

我已加盟电子科技大学基础与前沿研究院，目前研究经费充足，招收博士后、访问学生以及2019级硕士研究生，待遇十分优厚。感兴趣的同学欢迎邮件联系，署名邮件必回复

研究方向

电子科大邹权组招聘博后、科研助理和访问学生（生物信息学方向）

  • 利用Hadoop或CUDA解决生物信息学问题
    • 多序列比对
    • 进化树构建
    • motif和network motif
    • 全基因组关联分析
  • microRNA及其他ncRNA的挖掘、疾病关系预测及相关计算问题
    • microRNA的识别和挖掘系统
    • microRNA-disease关系预测
    • ncRNA的家族预测
  • 利用机器学习方法解决各种蛋白质分类问题
    • 蛋白质折叠模式和超家族的预测
    • 特殊蛋白质的识别
    • 蛋白质相互作用预测
    • 集成分类器及相关机器学习问题

讲授课程

  • 算法分析与设计
  • 数据挖掘与知识发现
  • 计算机基础

主持项目

  • 国家自然科学基金面上项目 利用多序列比对指导16s rRNA的OTU聚类
  • 国家自然科学基金面上项目 基于MapReduce的非编码RNA“从头预测”识别方法研究 (已结题)
  • 国家自然科学基金青年基金 基于投票机制的非编码RNA“从头预测”识别方法研究 (已结题)
  • 福建省自然科学基金面上项目 转录组数据中的microRNA和SNP挖掘方法研究 (已结题)

学术兼职

  • Editor-in-Chief of Current Bioinformatics
  • Associate Editor of IEEE Access
  • Editorial Board Member of Computers in Biology and Medicine, Scientific Report, PLoS ONE, Interdisciplinary Sciences–Computational Life Sciences, Genes

出版著作

  • Jon Galloway, Phil Haack, Brad Wilson等著. 孙远帅, 邹权译. ASP.NET MVC 4高级编程（第4版）.清华大学出版社. 2013.8 ISBN：9787302330035
  • 系统生物学的网络分析方法. 邹权, 陈启安, 曾湘祥, 刘向荣 编著. 西安电子科技大学出版社. 2015.6. ISBN：9787560635385
  • Quan Zou (Ed.) Special Protein Molecules Computational Identification. MDPI. St. Alban-Anlage 66. Basel, Switzerland. ISBN: 9783038970439 (Pbk) 9783038970446 (PDF) doi:10.3390/books978-3-03897-044-6

特约报告

  • 生物信息学中的不确定性和分类问题. CRSSC-CWI-CGrC2014青年学者论坛. 2014.8.7. 昆明. PPT
  • Machine learning and computational problems in genome-wide association study. CAAI机器学习专委会首届青年学者交流会. 2014.8.15. 南昌 PPT
  • Reconstructing phylogenetic trees for ultra-large unaligned DNA sequences via with Hadoop. The 9th International Conference on Systems Biology (ISB 2015). 2015.8.21. 洛阳 PPT
  • Computational prediction of miRNA and miRNA-disease relationship. 2015 Asian Conference on Membrane Computing (ACMC2015). 2015.11.14. 合肥 PPT
  • DNA多序列比对中的算法技术和并行方法. 2016大数据与精准生物医学信息学研讨会. 2016.3.26. 上海. PPT
  • LibD3C: an imbalanced ensemble classifier without any parameter tuning. 第二届生物信息学与药物设计研讨会. 2016.7.30. 重庆 PPT
  • Hierarchical learning and high dimensionality problems in bioinformatics. 中国人工智能学会机器学习专委会青年学者论坛. 2017.9.8. 西安 PPT
  • 基因序列的比对、挖掘和功能分析. 第二届中国计算机学会生物信息学会议. 2017.10.14. 长沙. PPT

代表论文

(*Corresponding author)

  1. Xiangxiang Zeng, Wei Lin, Maozu Guo, Quan Zou*. A comprehensive overview and evaluation of circular RNA detection tools. PLoS Computational Biology. 2017,13(6): e1005420 (SCI, IF2015=4.587, PMID: 28594838) (data and codes)(BibTeX, EndNote)
  2. Quan Zou*, Pengwei Xing, Leyi Wei, Bin Liu*. Gene2vec: Gene Subsequence Embedding for Prediction of Mammalian N6‐Methyladenosine Sites from mRNA. RNA. Doi: 10.1261/rna.069112.118 (SCI, IF2016=4.605, PMID: 30425123) (web server)
  3. Quan Zou*, Qinghua Hu, Maozu Guo, Guohua Wang*. HAlign: Fast Multiple Similar DNA/RNA Sequence Alignment Based on the Centre Star Strategy. Bioinformatics. 2015,31(15): 2475-2481. (SCI, IF2016=7.307, PMID: 25812743) (Software)(该软件被OMICTOOLS推荐)(BibTeX, EndNote)
  4. Wei Tang, Shixiang Wan, Zhen Yang, Andrew E. Teschendorff*, Quan Zou*. Tumor Origin Detection with Tissue-Specific miRNA and DNA methylation Markers. Bioinformatics. 2018, 34(3): 398-406. (SCI, IF2016=7.307, PMID:29028927) (web server)(BibTeX, EndNote)
  5. Leyi Wei, Shasha Luan, Luis Eijy Nagai, Ran Su*, Quan Zou*. Exploring sequence-based features for the improved prediction of DNA N4-methylcytosine sites in multiple species. Bioinformatics. Doi: 10.1093/bioinformatics/bty824. (SCI, IF2016=7.307, PMID: 30239627)(web server)
  6. Cangzhi Jia*, Yun Zuo, Quan Zou*. O-GlcNAcPRED-II: an integrated classification algorithm for identifying O-GlcNAcylation sites based on fuzzy undersampling and a K-means PCA oversampling technique. Bioinformatics. 2018, 34(12): 2029-2036. (SCI, IF2016=7.307, PMID:29420699)(web server)(该软件被OMICTOOLS推荐)(BibTeX, EndNote)
  7. Xiangxiang Zeng, Li Liu, Linyuan Lu*, Quan Zou*. Prediction of potential disease-associated microRNAs using structural perturbation method. Bioinformatics. 2018, 34(14): 2425-2432.(SCI, IF2016=7.307, PMID:29490018)(codes)(BibTeX, EndNote)
  8. Wenying He, Cangzhi Jia*, Quan Zou*. 4mCPred: Machine Learning Methods for DNA N4-methylcytosine sites Prediction. Bioinformatics. doi: 10.1093/bioinformatics/bty668 (SCI, IF2016=7.307, PMID: 30052767)(web server)(该软件被OMICTOOLS推荐)
  9. Jianbo Pan, Shichang Hu, Hao Wang, Quan Zou*, Zhiliang Ji*. PaGeFinder: Quantitative Identification of Spatiotemporal Pattern Genes. Bioinformatics. 2012, 28(11):1544-1545. (SCI, IF2016=7.307, PMID:22492640)(Web Server)(BibTeX, EndNote)
  10. Quan Zou, Gang Lin, Xingpeng Jiang, Xiangrong Liu, Xiangxiang Zeng. Sequence clustering in bioinformatics: an empirical study. Briefings in Bioinformatics. Doi: 10.1093/bib/bby090 (SCI, IF2016=5.134, PMID: 30239587)(data)
  11. Quan Zou*, Xubin Li, Wenrui Jiang, Ziyu Lin, Guilin Li, Ke Chen. Survey of MapReduce Frame Operation in Bioinformatics. Briefings in Bioinformatics. 2014,15(4): 637-647. (SCI, IF2016=5.134, PMID: 23396756)(BibTeX, EndNote)
  12. Xiangxiang Zeng, Xuan Zhang, Quan Zou*. Integrative approaches for predicting microRNA function and prioritizing disease-related microRNA using biological interaction networks. Briefings in Bioinformatics. 2016,17(2):193-203.(SCI, IF2016=5.134, PMID:26059461)(BibTeX, EndNote)
  13. Leyi Wei, Jie Hu, Fuyi Li, Jiangning Song*, Ran Su*, Quan Zou*. Comparative analysis and prediction of quorum-sensing peptides using feature representation learning and machine learning algorithms. Briefings in Bioinformatics. Doi: 10.1093/bib/bby107. (web server)
  14. Bin Liu*, Shuangyan Jiang, Quan Zou*. HITS-PR-HHblits: Protein remote homology detection by combining pagerank and hyperlink-induced topic search. Briefings in Bioinformatics. Doi: 10.1093/bib/bby104.(web server)
  15. Leyi Wei, Pengwei Xing, Gaotao Shi, Zhiliang Ji*, Quan Zou*. Fast prediction of protein methylation sites using a sequence-based feature selection technique. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Doi: 10.1109/TCBB.2017.2670558. (SCI, IF2015=1.609, PMID:28222000)(web server)(该软件被OMICTOOLS推荐)
  16. Xiangxiang Zeng, Yuanlu Liao, Yuansheng Liu, Quan Zou*. Prediction and validation of disease genes using HeteSim Scores. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2017, 14(3):687-695. (SCI, IF2015=1.609, PMID:26890920)(Codes and Data)(BibTeX, EndNote)
  17. Yuansheng Liu, Xiangxiang Zeng, Zengyou He*, Quan Zou*. Inferring microRNA-disease associations by random walk on a heterogeneous network with multiple data sources. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2017, 14(4): 905-915.(Web Server)(SCI, IF2015=1.609, PMID:27076459)(BibTeX, EndNote)
  18. Leyi Wei, Minghong Liao, Yue Gao, Rongrong Ji, Zengyou He*, Quan Zou*. Improved and Promising Identification of Human MicroRNAs by Incorporating a High-quality Negative Set. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2014, 11(1):192-201 (Software) (SCI, IF2015=1.609, PMID: 24216114)(BibTeX, EndNote)
  19. Leyi Wei, Pengwei Xing, Jijun Tang, Quan Zou*. PhosPred-RF: a novel sequence-based predictor for phosphorylation sites using sequential information only. IEEE Transactions on NanoBioscience. 2017, 16(4): 240-247. (SCI, IF2015=1.969, PMID:28166503) (web server)(BibTeX, EndNote)
  20. Wenhe Su, Xiangke Liao, Yutong Lu, Quan Zou*, Shaoliang Peng*. Multiple Sequence Alignment Based on a Suffix Tree and Center-Star Strategy: A Linear Method for Multiple Nucleotide Sequence Alignment on Spark Parallel Framework. Journal of Computational Biology. 2017, 24(12): 1230-1242 (SCI, IF2016=1.032, PMID: 29116822) (codes)(该软件被OMICTOOLS推荐)(BibTeX, EndNote)
  21. Pei Li, Maozu Guo, Chunyu Wang, Xiaoyan Liu, Quan Zou*. An overview of SNP interactions in genome-wide association studies. Briefings in Functional Genomics. 2015, 14(2):143-155. (SCI, IF2017=3.783,PMID: 25241224)(BibTeX, EndNote)
  22. Quan Zou, Jinjin Li, Li Song, Xiangxiang Zeng, Guohua Wang. Similarity computation strategies in the microRNA-disease network: A Survey. Briefings in Functional Genomics. 2016, 15(1): 55-64. (SCI, IF2017=3.783,PMID: 26134276)most cited articles in this journal(BibTeX, EndNote)
  23. Wenying He, Leyi Wei, Quan Zou*. Research Progress in Protein Post-Translational Modification Site Prediction. Briefings in Functional Genomics. Accepted. (SCI, IF2017=3.783, PMID: )
  24. Zhiqiang Zhang, Yi Zhao, Xiangke Liao, Wenqiang Shi, Kenli Li, Quan Zou*, Shaoliang Peng*. Deep learning in omics: a survey and guideline. Briefings in Functional Genomics. doi: 10.1093/bfgp/ely030 (SCI, IF2017=3.783, PMID: 30265280)
  25. Leyi Wei, Jijun Tang, Quan Zou*. Local-DPP: An Improved DNA-binding Protein Prediction Method by Exploring Local Evolutionary Information. Information Sciences. 2017, 384:135-144. (SCI, IF2015=3.364)(web server)(BibTeX, EndNote)
  26. Leyi Wei, Yijie Ding, Ran Su, Jijun Tang, Quan Zou*. Prediction of human protein subcellular localization using deep learning. Journal of Parallel and Distributed Computing. 2018, 117: 212-217 (SCI, IF2015=1.320)(BibTeX, EndNote)
  27. 林子雨, 赖明星, 邹权*, 薛永生, 杨思颖. 基于替换概率的闪存数据库缓冲区替换算法. 计算机学报. 2013, 36(8):1568-1581
  28. 邹权, 郭茂祖, 刘扬, 王峻. 类别不平衡的分类方法及在生物信息学中的应用. 计算机研究与发展. 2010,47(8):1407-1414 (软件与数据) 该论文获第三届中国数据挖掘会议（CCDM2009）大会优秀学生论文
  29. 邹权, 李旭斌, 林子雨, 江弋, 林琛. 下一代测序技术数据中的选择性剪切计算识别方法研究. 电子学报. 2012, 40(2):350-357
  30. 邹权, 郭茂祖, 王晓凯, 张涛涛. 基于关键字树的DNA多序列星比对算法. 电子学报. 2009,37(8):1746-1750 (软件)
  31. 邹权, 郭茂祖, 张涛涛. RNA二级结构预测方法综述. 电子学报. 2008,36(2):331-337
  32. Senjie Lin, Shifeng Cheng, Bo Song, Xiao Zhong, Xin Lin, Wujiao Li, Ling Li, Yaqun Zhang, Huan Zhang, Zhiliang Ji, Meichun Cai, Yunyun Zhuang, Xinguo Shi, Lingxiao Lin, Lu Wang, Zhaobao Wang, Xin Liu, Sheng Yu, Peng Zeng, Han Hao, Quan Zou, Chengxuan Chen, Yanjun Li, Ying Wang, Chunyan Xu, Shanshan Meng, Xun Xu, Jun Wang, Huanming Yang, David A. Campbe, Nancy R. Sturm, Steve Dagenais-Bellefeuille, David Morse. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015, 350(6261): 691-694. (SCI, IF2015=34.661, PMID: 26542574)(Web Server)(基金委报导)

所获奖励

  • 第二届中国计算机学会生物信息学会议最佳论文奖
  • 2016年 《生物信息学》优秀审稿专家
  • 2014年 CCDM数据挖掘竞赛第一名
  • 2013年 厦门大学第七届高等教育教学成果二等奖（题目: 公共计算机课程体系改革研究与实施, 排名第5）
  • 哈尔滨工业大学2009年优秀毕业生
  • 2009年 黑龙江省高校科学技术奖二等奖（题目: 计算分子生物学中的学习方法研究 证书号：2009-072-06）
  • 第三届中国数据挖掘会议（CCDM2009）大会优秀学生论文

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