目录
一、数据库文件差异
MyISAM
InnoDB
二、索引差异
1.关于自动增长
2.关于主键
3.关于Count函数
4.全文索引
5.Delete from table
6.索引保存位置
三、其他对比
1.可移植性、备份及恢复
2.事务支持
3.表锁差异
一、数据库文件差异
MyISAM
属于堆表，可被压缩，存储空间较小。
在磁盘存储上有是三个文件，每个文件名以表名开头，扩展名指出文件类型
- .frm：用户存储表的定义
- .MYD：用于存放数据
- .MYI：用于存放表索引
MyISAM支持三种不同存储格式
- 静态表（默认，但是注意数据末尾不能有空格，会被去掉）
- 动态表
- 压缩表
InnoDB
属于索引组织表，所有的表都保存在同一个数据文件中（也可能是多个文件，或者是独立的表空间文件），需要更多的内存和存储，它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。
有两种存储方式
- 共享表空间
- 多表空间存储
如果使用共享表空间，那么所有表的数据文件和索引文件都保存在一个表空间里，一个表空间可以有多个文件，通过InnoDB_data_file_path和InnoDB_data_home_dir参数设置共享表空间的位置和名字，一般共享表空间的名字叫ibdata1-n。
如果使用多表空间，那么每个表都有一个表空间文件用于存储每个表的数据和索引，文件名以表名开头，以.ibd为扩展名
二、索引差异
1.关于自动增长
MyISAM引擎的自动增长列必须是索引，如果是组合索引，自动增长可以不是第一列，它会根据前几列排序后递增。可以和其他字段一起建立联合索引。
InnoDB引擎的自动增长必须是索引，如果是组合索引也必须是组合索引的第一列。必须包含只有该字段的索引。
2.关于主键
MyISAM允许没有任何索引和主键的表存在；MyISAM的索引都是保存行的地址
InnoDB引擎如果没有设定主键或者非空唯一索引，就会自动生成一个6字节的主键（用户不可见）；InnoDB的数据是主索引的一部分，附加索引保存的是主索引的值。
3.关于Count函数
MyISAM保存有表的总行数，如果select count（*） from table;会直接取出该值
InnoDB没有保存表的总行数，如果使用select count（*） from table;就会遍历整个表，消耗相当大，但是在加了where条件判断后，MyISAM和InnoDB处理的方式都一样。
4.全文索引
MyISAM支持Fulltext类型的全文索引
InnoDB不支持Fulltext类型的全文索引，但是InnoDB可以使用Sphinx插件支持全文索引，并且效果更好。（Sohinx是一个开源软件，提供多种语言的API接口，可以优化Mysql的各种查询）
5.Delete from table
使用这条命令时，InnoDB不会重新建立表，而是一条一条的删除数据，在InnoDB上如果要清空保存有大量数据的表，最好不要使用该命令。（推荐使用Truncate table，不过需要用户拥有Drop此表的权限）
6.索引保存位置
MyISAM的索引以表名+.MYI文件分别保存
InnoDB的索引和数据一起保存在表空间里
三、其他对比
1.可移植性、备份及恢复
MyISAM：数据是以文件的形式存储，所以在跨平台的数据转移中会很方便。在备份和恢复时可单独针对某个表进行操作。
InnoDB：免费的方案可以是拷贝数据文件、备份binlog，或者使用MysqlDump，在数据量达到几十G的时候就相对痛苦了。
2.事务支持
MyISAM：强调的是性能，每次查询具有原子性，其执行数度比InnoDB类型更快，但是不提供事务支持
InnoDB：提供事务支持事务，外部键等高级数据库功能。具有事务（Commit）、回滚（Rollback）和崩溃修复能力（Crash Recovery Capabilities）的事务安全（Transaction-safe（ACID Compliant））型表
3.表锁差异
MyISAM：只支持表级锁，用户在操作MyISAM表时，select，update，delete，insert语句都会给表自动加锁，如果加锁以后的表满足insert并发的情况下，可以在表的尾部插入新的数据。
InnoDB：支持事务和行级锁，是InnoDB的最大特色。行锁大幅度提高了多用户并发操作的性能。但是InnoDB的行锁，只是在Where的主键是有效的，非主键的Where都会锁全表的。