医学图像dcm2d切片文件转3dnii文件

时间:2024-03-01 08:16:37

安装

conda:

conda install -c conda-forge dicom2nifti

pip:

pip install dicom2nifti

更新

conda:

conda update dicom2nifti

pip:

pip install dicom2nifti --upgrade

可以将包含dcm文件的目录转换为nii文件,也可以只转一个文件夹,详情

执行下列程序:

import dicom2nifti
# 多个dicom文件转化为3D nii文件
# \'E:/COVID-19CTimageAnal/data\'为存放dcm2d切片文件的目录
original_dicom_directory = \'E:/COVID-19CTimageAnal/data\'
# \'0007686236.nii\'为要生成的nii文件名
output_file = \'0007686236.nii\'
dicom2nifti.dicom_series_to_nifti(original_dicom_directory, output_file, reorient_nifti=True)