内存溢出问题是参加kaggle比赛或者做大数据量实验的第一个拦路虎。
以前做的练手小项目导致新手产生一个惯性思维——读取训练集图片的时候把所有图读到内存中,然后分批训练。
其实这是有问题的,很容易导致OOM。现在内存一般16G,而训练集图片通常是上万张,而且RGB图,还很大,VGG16的图片一般是224x224x3,上万张图片,16G内存根本不够用。这时候又会想起——设置batch,但是那个batch的输入参数却又是图片,它只是把传进去的图片分批送到显卡,而我OOM的地方恰是那个“传进去”的图片,怎么办?
解决思路其实说来也简单,打破思维定式就好了,不是把所有图片读到内存中,而是只把所有图片的路径一次性读到内存中。
大致的解决思路为:
将上万张图片的路径一次性读到内存中,自己实现一个分批读取函数,在该函数中根据自己的内存情况设置读取图片,只把这一批图片读入内存中,然后交给模型,模型再对这一批图片进行分批训练,因为内存一般大于等于显存,所以内存的批次大小和显存的批次大小通常不相同。
下面代码分别介绍Tensorflow和Keras分批将数据读到内存中的关键函数。Tensorflow对初学者不太友好,所以我个人现阶段更习惯用它的高层API Keras来做相关项目,下面的TF实现是之前不会用Keras分批读时候参考的一些列资料,在模型训练上仍使用Keras,只有分批读取用了TF的API。
Tensorlow
在input.py里写get_batch函数。
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def get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, batch_size, capacity):
'''
Args:
X_train: train img path list
y_train: train labels list
img_w: image width
img_h: image height
batch_size: batch size
capacity: the maximum elements in queue
Returns:
X_train_batch: 4D tensor [batch_size, width, height, chanel],\
dtype=tf.float32
y_train_batch: 1D tensor [batch_size], dtype=int32
'''
X_train = tf.cast(X_train, tf.string)
y_train = tf.cast(y_train, tf.int32)
# make an input queue
input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train, y_train])
y_train = input_queue[ 1 ]
X_train_contents = tf.read_file(input_queue[ 0 ])
X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents, channels = color_type)
X_train = tf.image.resize_images(X_train, [img_h, img_w],
tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR)
X_train_batch, y_train_batch = tf.train.batch([X_train, y_train],
batch_size = batch_size,
num_threads = 64 ,
capacity = capacity)
y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch, 10 )
return X_train_batch, y_train_batch
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在train.py文件中训练(下面不是纯TF代码,model.fit是Keras的拟合,用纯TF的替换就好了)。
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X_train_batch, y_train_batch = inp.get_batch(X_train, y_train,
img_w, img_h, color_type,
train_batch_size, capacity)
X_valid_batch, y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid, y_valid,
img_w, img_h, color_type,
valid_batch_size, capacity)
with tf.Session() as sess:
coord = tf.train.Coordinator()
threads = tf.train.start_queue_runners(coord = coord)
try :
for step in np.arange(max_step):
if coord.should_stop() :
break
X_train, y_train = sess.run([X_train_batch,
y_train_batch])
X_valid, y_valid = sess.run([X_valid_batch,
y_valid_batch])
ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5'
ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path,
monitor = 'val_loss' ,
verbose = 1 ,
save_best_only = True ,
mode = 'min' )
model.fit(X_train, y_train, batch_size = 64 ,
epochs = 50 , verbose = 1 ,
validation_data = (X_valid, y_valid),
callbacks = [ckpt])
del X_train, y_train, X_valid, y_valid
except tf.errors.OutOfRangeError:
print ( 'done!' )
finally :
coord.request_stop()
coord.join(threads)
sess.close()
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Keras
keras文档中对fit、predict、evaluate这些函数都有一个generator,这个generator就是解决分批问题的。
关键函数:fit_generator
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# 读取图片函数
def get_im_cv2(paths, img_rows, img_cols, color_type = 1 , normalize = True ):
'''
参数:
paths:要读取的图片路径列表
img_rows:图片行
img_cols:图片列
color_type:图片颜色通道
返回:
imgs: 图片数组
'''
# Load as grayscale
imgs = []
for path in paths:
if color_type = = 1 :
img = cv2.imread(path, 0 )
elif color_type = = 3 :
img = cv2.imread(path)
# Reduce size
resized = cv2.resize(img, (img_cols, img_rows))
if normalize:
resized = resized.astype( 'float32' )
resized / = 127.5
resized - = 1.
imgs.append(resized)
return np.array(imgs).reshape( len (paths), img_rows, img_cols, color_type)
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获取批次函数,其实就是一个generator
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def get_train_batch(X_train, y_train, batch_size, img_w, img_h, color_type, is_argumentation):
'''
参数:
X_train:所有图片路径列表
y_train: 所有图片对应的标签列表
batch_size:批次
img_w:图片宽
img_h:图片高
color_type:图片类型
is_argumentation:是否需要数据增强
返回:
一个generator,x: 获取的批次图片 y: 获取的图片对应的标签
'''
while 1 :
for i in range ( 0 , len (X_train), batch_size):
x = get_im_cv2(X_train[i:i + batch_size], img_w, img_h, color_type)
y = y_train[i:i + batch_size]
if is_argumentation:
# 数据增强
x, y = img_augmentation(x, y)
# 最重要的就是这个yield,它代表返回,返回以后循环还是会继续,然后再返回。就比如有一个机器一直在作累加运算,但是会把每次累加中间结果告诉你一样,直到把所有数加完
yield ({ 'input' : x}, { 'output' : y})
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训练函数
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result = model.fit_generator(generator = get_train_batch(X_train, y_train, train_batch_size, img_w, img_h, color_type, True ),
steps_per_epoch = 1351 ,
epochs = 50 , verbose = 1 ,
validation_data = get_train_batch(X_valid, y_valid, valid_batch_size,img_w, img_h, color_type, False ),
validation_steps = 52 ,
callbacks = [ckpt, early_stop],
max_queue_size = capacity,
workers = 1 )
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就是这么简单。但是当初从0到1的过程很难熬,每天都没有进展,没有头绪,急躁占据了思维的大部,熬过了这个阶段,就会一切顺利,不是运气,而是踩过的从0到1的每个脚印累积的灵感的爆发,从0到1的脚印越多,后面的路越顺利。
以上这篇完美解决TensorFlow和Keras大数据量内存溢出的问题就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持服务器之家。
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