数据探索性分析(EDA)
1. 总览数据概况
数据库载入
#coding:utf-8 #导入warnings包,利用过滤器来实现忽略警告语句。 import warnings warnings.filterwarnings("ignore") import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns import missingno as msno
数据载入
## 1) 载入训练集和测试集; path = "./" Train_data = pd.read_csv(path+"car_train_0110.csv", sep=" ") Test_data = pd.read_csv(path+"car_testA_0110.csv", sep=" ")
确定path,如果是在notebook环境,我通常使用 !dir查看当前目录
特征说明
新技能:使用.append()同时观察前5行与后5行
## 2) 简略观察数据(head()+shape) Train_data.head().append(Train_data.tail())
观察数据维度
Train_data.shape,Test_data.shape
总览概况: .describe()查看统计量,.info()查看数据类型
1.1 判断数据缺失和异常
1.1.1 查看nan
Train_data.shape,Test_data.shape
也可直接查看nan,有以下两种方式 ↓ :
Train_data.isnull().sum()
可视化na更直观
# find na tmp = df_train.isnull().any() tmp[tmp.values==True]
新技能: msno库(缺失值可视化)的使用
Train_data.isnull().sum().plot( kind= "bar")
可视化看下缺省值
msno.matrix(Train_data.sample(250))
其中,Train_data.sample(250)表示随机抽样250行,白色条纹表示缺失
直接显示未缺失的样本数量/每特征
msno.bar(Train_data.sample(250),labels= True)
使用msno中的 .heatmap()查看缺失值之间的相关性
msno.heatmap(Train_data.sample(250))
1.1.2 *异常值检测(重要!易忽略)
通过Train_data.info()了解数据类型
Train_data.info()
1.2 了解预测值的分布
特征分为类别特征和数字特征
查看分布的意义在于:
a. 及时将非正态分布数据变化为正态分布数据
b. 异常检测
1.2.1 数字特征分析
Train_data["price"]
发现都是int
统计分布 ↓
Train_data["price"].value_counts()
## 1) 总体分布概况(*约翰逊分布等) import scipy.stats as st y = Train_data["price"] plt.figure(1); plt.title("Johnson SU") sns.distplot(y, kde=False, fit=st.johnsonsu) plt.figure(2); plt.title("Normal") sns.distplot(y, kde=False, fit=st.norm) plt.figure(3); plt.title("Log Normal") sns.distplot(y, kde=False, fit=st.lognorm)
结论:price不服从正态分布,因此在进行回归之前,它必须进行转换。*约翰逊分布拟合效果较好。
1.2.1.1 相关性分析
1.2.1.2 *偏度和峰值
偏度(skewness),统计数据分布偏斜方向和程度,是统计数据分布非对称程度的数字特征。定义上偏度是样本的三阶标准化矩。
峰度(peakedness;kurtosis)又称峰态系数。表征概率密度分布曲线在平均值处峰值高低的特征数。直观看来,峰度反映了峰部的尖度。
## 2) 查看skewness and kurtosis sns.distplot(Train_data["price"]); print("Skewness: %f" % Train_data["price"].skew()) print("Kurtosis: %f" % Train_data["price"].kurt())
批量计算skew
Train_data.skew()
查看skew的分布情况
批量计算kurt
Train_data.kurt()
查看kurt的分布情况
查看目标变量的分布
## 3) 查看预测值的具体频数 plt.hist(Train_data["price"], orientation = "vertical",histtype = "bar", color ="red") plt.show()
结论:大于20000得值极少,其实这里也可以把这些当作特殊得值(异常值)直接用填充或者删掉
由于np.log(0)==-inf,无法绘图,因此改用log(1+x)绘制分布bar,和教程里有出入,教程里用log绘图如下:(我画不出来,因为-inf会报错)
# log变换之后的分布较均匀,可以进行log变换进行预测,这也是预测问题常用的trick plt.hist(np.log(1+Train_data["price"]), orientation = "vertical",histtype = "bar", color ="red") plt.show()
分离label即预测值
Y_train = Train_data["price"]
#这个区别方式适用于没有直接label coding的数据
#这里不适用,需要人为根据实际含义来区分
#数字特征
numeric_features = Train_data.select_dtypes(include=[np.number])
numeric_features.columns
#类型特征
categorical_features = Train_data.select_dtypes(include=[np.object])
categorical_features.columns
numeric_features = ["power", "kilometer", "v_0", "v_1", "v_2", "v_3", "v_4", "v_5", "v_6", "v_7", "v_8", "v_9", "v_10", "v_11", "v_12", "v_13","v_14" ] categorical_features = ["name", "model", "brand", "bodyType", "fuelType", "gearbox", "notRepairedDamage", "regionCode",]
# 特征nunique分布 for cat_fea in categorical_features: print(cat_fea + "的特征分布如下:") print("{}特征有个{}不同的值".format(cat_fea, Train_data[cat_fea].nunique())) print(Train_data[cat_fea].value_counts())
每个特征情况都会逐个如下所示:
test data显示同理
numeric_features.append("price") numeric_features
price_numeric = Train_data[numeric_features] correlation = price_numeric.corr() correlation
只截了一部分
查看相关性(强->弱)
print(correlation["price"].sort_values(ascending = False)," ")
可视化correction
f , ax = plt.subplots(figsize = (7, 7)) plt.title("Correlation of Numeric Features with Price",y=1,size=16) sns.heatmap(correlation,square = True, vmax=0.8)
price完成历史使命,删掉
del price_numeric["price"]
## 2) 查看几个特征得 偏度和峰值 for col in numeric_features: print("{:15}".format(col), "Skewness: {:05.2f}".format(Train_data[col].skew()) , " " , "Kurtosis: {:06.2f}".format(Train_data[col].kurt()) )
1.2.1.3 *每个数字特征的分布可视化(易忽略)
## 3) 每个数字特征得分布可视化 f = pd.melt(Train_data, value_vars=numeric_features) g = sns.FacetGrid(f, col="variable", col_wrap=2, sharex=False, sharey=False) g = g.map(sns.distplot, "value")
只截了部分:
结论:匿名特征(v_*)相对分布均匀
1.2.1.4 *数字特征相互之间的关系可视化(易忽略)
## 4) 数字特征相互之间的关系可视化 sns.set() columns = ["price", "v_12", "v_8" , "v_0", "power", "v_5", "v_2", "v_6", "v_1", "v_14"] sns.pairplot(Train_data[columns],size = 2 ,kind ="scatter",diag_kind="kde") plt.show()
1.2.1.5 *多变量互相回归关系可视化(易忽略)
## 5) 多变量互相回归关系可视化 fig, ((ax1, ax2), (ax3, ax4), (ax5, ax6), (ax7, ax8), (ax9, ax10)) = plt.subplots(nrows=5, ncols=2, figsize=(24, 20)) # ["v_12", "v_8" , "v_0", "power", "v_5", "v_2", "v_6", "v_1", "v_14"] v_12_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_12"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_12",y = "price", data = v_12_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax1) v_8_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_8"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_8",y = "price",data = v_8_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax2) v_0_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_0"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_0",y = "price",data = v_0_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax3) power_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["power"]],axis = 1) sns.regplot(x="power",y = "price",data = power_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax4) v_5_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_5"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_5",y = "price",data = v_5_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax5) v_2_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_2"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_2",y = "price",data = v_2_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax6) v_6_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_6"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_6",y = "price",data = v_6_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax7) v_1_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_1"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_1",y = "price",data = v_1_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax8) v_14_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_14"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_14",y = "price",data = v_14_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax9) v_13_scatter_plot = pd.concat([Y_train,Train_data["v_13"]],axis = 1) sns.regplot(x="v_13",y = "price",data = v_13_scatter_plot,scatter= True, fit_reg=True, ax=ax10)
1.2.2 类别特征分析(会画,不会利用结果)
对类别特征查看unique分布
.value_counts()
## 1) unique分布 for fea in categorical_features: print(Train_data[fea].nunique()) categorical_features
1.2.2.1 箱形图可视化
## 2) 类别特征箱形图可视化 # 因为 name和 regionCode的类别太稀疏了,这里我们把不稀疏的几类画一下 categorical_features = ["model", "brand", "bodyType", "fuelType", "gearbox", "notRepairedDamage"] for c in categorical_features: Train_data[c] = Train_data[c].astype("category") if Train_data[c].isnull().any(): Train_data[c] = Train_data[c].cat.add_categories(["MISSING"]) Train_data[c] = Train_data[c].fillna("MISSING") def boxplot(x, y, **kwargs): sns.boxplot(x=x, y=y) x=plt.xticks(rotation=90) f = pd.melt(Train_data, id_vars=["price"], value_vars=categorical_features) g = sns.FacetGrid(f, col="variable", col_wrap=2, sharex=False, sharey=False, size=5) g = g.map(boxplot, "value", "price")
Train_data.columns
1.2.2.2 小提琴图可视化
## 3) 类别特征的小提琴图可视化 catg_list = categorical_features target = "price" for catg in catg_list : sns.violinplot(x=catg, y=target, data=Train_data) plt.show()
categorical_features = ["model", "brand", "bodyType", "fuelType", "gearbox", "notRepairedDamage"]
1.2.2.3 柱形图可视化类别
## 4) 类别特征的柱形图可视化 def bar_plot(x, y, **kwargs): sns.barplot(x=x, y=y) x=plt.xticks(rotation=90) f = pd.melt(Train_data, id_vars=["price"], value_vars=categorical_features) g = sns.FacetGrid(f, col="variable", col_wrap=2, sharex=False, sharey=False, size=5) g = g.map(bar_plot, "value", "price")
1.2.2.4 特征的每个类别频数可视化(count_plot)
## 5) 类别特征的每个类别频数可视化(count_plot) def count_plot(x, **kwargs): sns.countplot(x=x) x=plt.xticks(rotation=90) f = pd.melt(Train_data, value_vars=categorical_features) g = sns.FacetGrid(f, col="variable", col_wrap=2, sharex=False, sharey=False, size=5) g = g.map(count_plot, "value")
2. *用pandas_profiling生成数据报告(新技能)
import pandas_profiling
pfr = pandas_profiling.ProfileReport(Train_data) pfr.to_file("./example.html")
3. 小结
本次笔记虽然针对样本量较少的情况,但仍有一些可贵的思路:
a. 通过检查nan缺失情况,确定需要进一步处理的特征:
填充(填充方式是什么,均值填充,0填充,众数填充等);
舍去;
先做样本分类用不同的特征模型去预测。
b. 通过分布,进行异常检测
分析特征异常的label是否异常(或者偏离均值较远或者事特殊符号);
异常值是否应该剔除,还是用正常值填充,等。
c. 通过对laebl作图,分析标签的分布情况
d. 通过对特征作图,特征和label联合做图(统计图,离散图),直观了解特征的分布情况,通过这一步也可以发现数据之中的一些异常值等,通过箱型图分析一些特征值的偏离情况,对于特征和特征联合作图,对于特征和label联合作图,分析其中的一些关联性
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原文链接:https://blog.csdn.net/weixin_42143139/article/details/115772683