1. 预先准备
Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h。
源文件示例func.cpp
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] // [[Rcpp::plugins(cpp11)]] #include <RcppArmadillo.h> #include <vector> #include "./test_h.h" using namespace Rcpp; using namespace std; // using namespace arma; // [[Rcpp::export]] RObject func(){ arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu); std::cout<<CONDIT<<std::endl; return wrap(A); }
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用于指明需要使用RcppArmadillo。
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。
#include "./test_h.h":表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来,并加上.h。./表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。
// using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::。
func()函数将可以直接在R中调用。
头文件示例test_h.h
#include <iostream> #define CONDIT 1000
2. 创建R包步骤
新建R Package
选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到src文件夹下。
R包的文件结构
修改DESCRIPTION文件
将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。
Package: RcppPackTest Type: Package Title: What the Package Does (Title Case) Version: 0.1.0 Author: Who wrote it Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net> Description: More about what it does (maybe more than one line) Use four spaces when indenting paragraphs within the Description. License: What license is it under? Encoding: UTF-8 LazyData: true Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
Build & Reload 建立包
3. C++11标准问题
如果要使用C++11标准,第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码:
CXX = g++-4.8.1 PKG_CXXFLAGS = -std=c++11
第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
以上就是Rcpp和RcppArmadillo创建R包实现方式的详细内容,更多关于Rcpp和RcppArmadillo创建R包的资料请关注服务器之家其它相关文章!y
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