LabVantage的仪器数据采集组件为LIMS CI,是一个独立的应用程序/服务,实现仪器数据的采集(GC、LC等带有工作站的仪器)。
将仪器输出数据转换为LIMS所需数据并传输,使用Talend这款ETL工具实现。
Talend支持Excel、CSV等传统的数据类文件的读取,对于Word、PDF等报告类文件的读取并不适用。
简单仪器,例如PH、天平等,使用串口(RS232)或网口(TCP)实现数据的采集。复杂仪器,例如GC、LC、ICP、HPLC等采集仪器输出的数据文件或报告文件。
几个目录的作用:
- Import:仪器数据输出文件存放目录,相对于LIMS CI来说为输入目录。
- Backup:采集时将文件拷贝到此处进行处理,此处的文件为处理中的文件。
- FAIL:处理失败的文件
- LOGS:日志记录
- Export:导出LIMS的样品测试序列给仪器,具体格式视仪器上位机软件。