vs的插件webdeploymentsetup.msi进行编译，好处就是不会生成很多的.dll文件，每次修改代码的时候，如果修改的是cs文件，只需要将bin传进去就OK了，如果是页面，直接传页面就行了，很方便！可以到网上下载这个插件
而WebApplicationd则不需要，可以指定网站项目生成单一程序集，因为是独立的程序集，所以和其他项目一样可以指定应用程序集的名字、版本、输出位置等信息 ！
Vs2008与Vs2005编译策略
如果使用Vs2005和Vs2008中的WebSite时，都有自带的编译器，可以直接发布网站，但是这种编译发布方式不是很好，平常测试还可以，比如我们把一个做好的网站放到服务器上，过段时间，代码要进行修改，修改之后再次传到服务器上，需要整个项目都传一遍，相当麻烦，因为重新编译之后的bin里出现了好多和以前的不一样的.dll文件，页面也重新调用了这些文件，所以都要重新换一遍才可以，所以我们最好不要用自带的这种编译方式，采取编译工具进行编译发布，一般常用的是