由于通过svn导入项目，导致项目中多出WebContent文件夹，而在此之前正常的是WebRoot文件夹。这个WebContent删了之后还会自己冒出来。
直到我发现篇博客：http://blog.sina.cn/dpool/blog/s/blog_525960510100jo0j.html?vt=4
于是在Navigator中查找
1.调出Navigator窗口
2.快捷键全局查找 Ctrl+H
3.File Search
找到了之后 .classpath 、org.eclipse.wst.common.component 这两个文件中含有WebContent关键字
.classpath 文件中含有
<classpathentry kind="output" path="WebContent/WebRoot/WEB-INF/classes"/>
org.eclipse.wst.common.component文件中含有:
<property name="java-output-path" value="/paysys/WebContent/WebRoot/WEB-INF/classes"/>
删掉黄色背景的部分即可。