使用STS或者Eclipse这样的IDE创建Maven Web工程还真不是一般的麻烦！
看了网上不少的方法介绍，操作下来总有区别，不是这里不对就是那里不对。
下面是尝试了几次之后成功的方法，记录一下。
环境信息
Spring Tool Suite
Version: 3.8.3.RELEASE
Build Id: 201612191351
Platform: Eclipse Neon.2 (4.6.2)
Maven 3.3.9
创建Maven工程
File->New->Project，选择Maven Project
可以修改保存位置，这里使用默认，注意不勾选Create a simple project
选择maven-archetype-webapp，这里最新的版本是1.0
填写坐标：Group Id、ArtifactId、Version，然后点击Finish
刚生成的Maven工程看起来会有些问题，甚至提示错误，不用理，下面逐个解决。
刚创建完的工程，在Package Explorer里面src/main/resources可能显示的是普通的Folder而不是source folder，
这块可以调整Perspective试试，不要用Java EE，试试Java Perspective或者Spring Perspective。
如果还不行，就继续看下面的调整。
默认Java Compiler是1.5太低了，调整为1.7
提示Build可以点“Yes”
修改Java Build Path，从默认1.5改成1.7
如果已经安装了，但是STS中没有显示的话，可以点Installed JREs进行查看，点Add...添加
需要注意：路径是到jdk的路径，不是到jre
注意有错误提示：两个build path找不到，到Order and Export中勾选上，然后点Apply
然后到Source中看到还是提示missing
在Package Explorer中点工程的名字，右键->Maven->Update Project...，并勾选上Force Update of Snapshots/Releases，点OK
等着更新完了，再来查看Project->Properties->Java Build Path->Source 就没有找不到的提示了
修改src/test/java 和 src/test/resource对应的输出目录到target/test-classes
全都修改完了，还是能看到index.jsp提示错误，这是因为没有导入对应的javaee api依赖包
在pom.xml中添加javaee-api包依赖，保存之后瞬间错误提示就消失了
下面修改Project Facets，这块比较麻烦，通常上来就会出错
先改Java版本到1.7，然后点Apply
然后我们把Dynamic Web Module版本改到3.0，发现会提示错误
注意这里的操作很关键：
在Package Explorer中右键点击工程名称MavenWebDemo，选择Show in -> Navigator，然后展开.settings，逐个文件改一下配置
这个第一个需要改的，project版本号改到1.7.0
这个是第二个要改的，把jst.web版本改到3.0
然后再去查看Project->Properties->Project Facets，发现就都符合期望了
另外，为了防止乱码，要记得改一下编码为UTF-8，点Project->Properties->Resource->Text file encoding，改成UTF-8
参考链接：
使用maven创建web项目 http://blog.csdn.net/zhshulin/article/details/37921705
解决Cannot change version of project facet Dynamic web module to 2.5 http://blog.csdn.net/steveguoshao/article/details/38414145
Eclipse+Maven src/main/java not visible in src folder in Package Explorer http://*.com/questions/18790106/eclipsemaven-src-main-java-not-visible-in-src-folder-in-package-explorer