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选择Hibernate还是iBATIS都有它的道理：
Hibernate的特点：
Hibernate功能强大，数据库无关性好，O/R映射能力强，如果你对Hibernate相当精通，而且对Hibernate进行了适当的封装，那么你的项目整个持久层代码会相当简单，需要写的代码很少，开发速度很快，非常爽。以数据库字段一一对应映射得到的PO和Hibernte这种对象化映射得到的PO是截然不同的，本质区别在于这种PO是扁平化的，不像Hibernate映射的PO是可以表达立体的对象继承，聚合等等关系的，这将会直接影响到你的整个软件系统的设计思路。Hibernate对数据库结构提供了较为完整的封装，Hibernate的O/R Mapping实现了POJO 和数据库表之间的映射，以及SQL 的自动生成和执行。程序员往往只需定义好了POJO 到数据库表的映射关系，即可通过Hibernate 提供的方法完成持久层操作。程序员甚至不需要对SQL 的熟练掌握， Hibernate/OJB 会根据制定的存储逻辑，自动生成对应的SQL 并调用JDBC 接口加以执行。Hibernate的缺点就是学习门槛不低，要精通门槛更高，而且怎么设计O/R映射，在性能和对象模型之间如何权衡取得平衡，以及怎样用好Hibernate方面需要你的经验和能力都很强才行，但是Hibernate现在已经是主流O/R Mapping框架，从文档的丰富性，产品的完善性，版本的开发速度都要强于iBATIS。
iBATIS的特点：
iBATIS入门简单，即学即用，提供了数据库查询的自动对象绑定功能，而且延续了很好的SQL使用经验，对于没有那么高的对象模型要求的项目来说，相当完美。iBATIS的缺点就是框架还是比较简陋，功能尚有缺失，虽然简化了数据绑定代码，但是整个底层数据库查询实际还是要自己写的，工作量也比较大，而且不太容易适应快速数据库修改。当系统属于二次开发,无法对数据库结构做到控制和修改,那iBATIS的灵活性将比Hibernate更适合。系统数据处理量巨大，性能要求极为苛刻，这往往意味着我们必须通过经过高度优化的SQL语句（或存储过程）才能达到系统性能设计指标。在这种情况下iBATIS会有更好的可控性和表现。
对于实际的开发进行的比较：
1． iBATIS需要手写sql语句，也可以生成一部分，Hibernate则基本上可以自动生成，偶尔会写一些Hql。同样的需求,iBATIS的工作量比 Hibernate要大很多。类似的，如果涉及到数据库字段的修改，Hibernate修改的地方很少，而iBATIS要把那些sql mapping的地方一一修改。
2. iBatis 可以进行细粒度的优化
比如说我有一个表，这个表有几个或者几十个字段，我需要更新其中的一个字段，iBatis 很简单，执行一个sql UPDATE TABLE_A SET column_1=#column_1# WHERE id=#id# 但是用 Hibernate 的话就比较麻烦了,缺省的情况下 hibernate 会更新所有字段。 当然我记得 hibernate 有一个选项可以控制只保存修改过的字段，但是我不太确定这个功能的负面效果。
例如：我需要列出一个表的部分内容，用 iBatis 的时候，这里面的好处是可以少从数据库读很多数据，节省流量SELECT ID, NAME FROM TABLE_WITH_A_LOT_OF_COLUMN WHERE ...一般情况下Hibernate 会把所有的字段都选出来。比如说有一个上面表有8个字段，其中有一两个比较大的字段，varchar(255)/text。上面的场景中我为什么要把他们也选出来呢？用hibernate 的话，你又不能把这两个不需要的字段设置为lazy load，因为还有很多地方需要一次把整个 domain object 加载出来。这个时候就能显现出ibatis 的好处了。如果我需要更新一条记录（一个对象），如果使用 hibernate，需要现把对象 select 出来，然后再做 update。这对数据库来说就是两条sql。而iBatis只需要一条update的sql就可以了。减少一次与数据库的交互，对于性能的提升是非常重要。
3. 开发方面：
开发效率上，我觉得两者应该差不多。可维护性方面，我觉得 iBatis 更好一些。因为 iBatis 的 sql 都保存到单独的文件中。而 Hibernate 在有些情况下可能会在 java 代码中保sql/hql。相对Hibernate“O/R”而言，iBATIS 是一种“Sql Mapping”的ORM实现。（iBatis 是将sql写在配置文件中的，而hibernate是自己生成的） 而iBATIS 的着力点，则在于POJO 与SQL之间的映射关系。也就是说，iBATIS并不会为程序员在运行期自动生成SQL 执行。具体的SQL 需要程序员编写，然后通过映射配置文件，将SQL所需的参数，以及返回的结果字段映射到指定POJO。使用iBATIS 提供的ORM机制，对业务逻辑实现人员而言，面对的是纯粹的Java对象，这一层与通过Hibernate 实现ORM 而言基本一致，而对于具体的数据操作，Hibernate会自动生成SQL 语句，而iBATIS 则要求开发者编写具体的SQL 语句。相对Hibernate而言，iBATIS 以SQL开发的工作量和数据库移植性上的让步，为系统设计提供了更大的*空间。
4. 运行效率
在不考虑 cache 的情况下，iBatis 应该会比hibernate 快一些或者很多。