MyISAM：这个是默认类型，它是基于传统的ISAM类型，ISAM是Indexed Sequential Access Method （有索引的顺序访问方法) 的缩写，它是存储记录和文件的标准方法。与其他存储引擎比较，MyISAM具有检查和修复表格的大多数工具。 MyISAM表格可以被压缩，而且它们支持全文搜索。它们不是事务安全的，而且也不支持外键。如果事物回滚将造成不完全回滚，不具有原子性。如果执行大量的SELECT，MyISAM是更好的选择。
InnoDB：这种类型是事务安全的。它与BDB类型具有相同的特性，它们还支持外键。InnoDB表格速度很快。具有比BDB还丰富的特性，因此如果需要一个事务安全的存储引擎，建议使用它。如果你的数据执行大量的INSERT或UPDATE，出于性能方面的考虑，应该使用InnoDB表，对于支持事物的InnoDB类型的表，影响速度的主要原因是AUTOCOMMIT默认设置是打开的，而且程序没有显式调用BEGIN开始事务，导致每插入一条都自动Commit，严重影响了速度。可以在执行SQL前调用BEGIN，多条SQL形成一个事物（即使AUTOCOMMIT打开也可以），将大大提高性能。
使用时注意：
1、4.0以上MySQL都支持事务，包括非max版本。3.23的需要max版本MySQL才能支持事务。
2、创建表时如果不指定type则默认为MyISAM，不支持事务，可以用以下命令看表的类型：
show create table tablename
3、对不支持事务的表做start/commit操作没有任何效果，在执行commit前已经提交，测试如下：
--执行一个msyql： use test; drop table if exists tn; create table tn （a varchar（10)) type=myisam; drop table if exists ty; create table ty （a varchar（10)) type=innodb; begin; insert into tn values（'a'); insert into ty values（'a'); select * from tn; select * from ty; --都能看到一条记录 --执行另一个mysql： use test; select * from tn; select * from ty; --只有tn能看到一条记录 --然后在另一边 commit; --才都能看到记录。
4、可以执行以下命令来切换非事务表到事务（数据不会丢失），InnoDB表比MyISAM表更安全：
alter table tablename type=InnoDB;
5、InnoDB表不能用repair table命令和myisamchk -r table_name命令，但可以用check table，以及mysqlcheck [OPTIONS] database [tables]。
6、启动MySQL数据库的命令行中添加了以下参数可以使新发布的MySQL数据表都默认为使用事务（只影响到create语句）。
–default-table-type=InnoDB
--测试命令： use test; drop table if exists tn; create table tn （a varchar（10)); show create table tn;
7、临时改变默认表类型可以用：
set table_type=InnoDB; show variables like 'table_type'; --或命令行命令： mysqld -max-nt –standalone –default-table-type=InnoDB
8、对于MySQL来说，最具有代表性的表存储引擎就是InnoDB和MyISAM。两者之间最主要的区别就是是否进行外键的数据完整性检查。
InnoDB存储引擎支持对外键约束的检查功能，这些约束包括delete，update，cascade，外键约束检查（外键增强）的好处或者优点如下：
- 如果关联设计恰当，可以使程序员更难将数据不一致性引入数据库。
- 数据库服务器具有集中式约束检查功能，就可以不必再应用程序一侧对数据进行该类检查，从而避免了不同的引用程序使用不同的方式去检查约束。
- 使用级联更新和删除，简化了应用程序代码。
- 设计欠当的关联，有助于使用文档的方式记录表间的关系。
但是以上的好处，需要数据库服务器为执行此类检查花费额外的开销，增加了数据库服务器的负担，进而影响数据库的性能。
如果在表中不需要外键，也想避免引用完整性的检查，则可以选择使用MyISAM存储引擎。对于那些只有insert和select的应用程序，选择MyISAM会获得更好的性能。但是如果使用MyISAM引擎时，如果有外键关联，那么需要再应用程序级的层面上处理这类关联，使得数据的完整性获得保证。
DBA（数据库管理员）要创建拓扑关联，这样会导致恢复单个表变的困难（加载依赖其他表的表时，MySQL允许你临时禁止外键检查，从而降低了该难度）。对于存在外键的表的，需要注意这个问题。