Ubuntu-16.04 R 安装及Jupyter notebook 配置

时间：2021-07-24 22:47:33

1. R 安装

通常在Terminal下直接apt-get 即可，在16.10下可以get到R-3.3.1，目前最新好像是 R-3.4.2，可以去官方网站下载源码编译 (https://www.r-project.org)​

sudo apt-get install r-base

 

2. 在jupyter notebook中配置R的kernel

近期在Jupyter下跑python，方便边调试边记笔记。因为Jupyter也支持R语言，所以尝试添加R kernel到Jupyter中。 主要依赖 "IRkernel" 包。(有些包可能需要FQ才能下载，具体的方法请DIY。) 配置方法如下：

(1) 安装必要的lib

sudo apt-get install libzmq3-dev libssl-dev libcurl​4-openssl-dev

sudo R # 进入R环境​

> ​ install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest')) 

注： 会提示选择mirrors， 建议选择 0-cloud 

> devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')

>​ IRkernel::installspec()

如果显示​如下结果，说明配置成功。 

[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in /home/xxx/.local/share/jupyter/kernels/ir​

注意：在jupyter上加载R包时一定要设定镜像，不然一般会失败：

# 通过如下命令设定镜像,比如我选择镜像ustc
options(repos = 'http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/')
# 检查镜像是否更改
getOption('repos')

 

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