从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

时间:2022-09-14 19:23:25

一.MATLAB应用软件介绍

从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

MATLAB是一种科学计算软件,专门以矩阵的形式处理数据。MATLAB将高性能的数值计算和可视化集成在一起,并提供了大量的内置函数,从而被广泛地应用于科学计算、控制系统、信息处理等领域的分析、仿真和设计工作,而且利用MATLAB产品的开放式结构,可以非常容易地对MATLAB的功能进行扩充,从而不断深化对问题认识,更多提升MATLAB产品应用范围。

MATLAB产品广泛应用于各个行业,典型应用:

1 数值分析、数值和符号计算、工程与科学绘图

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2 控制系统的设计与仿真

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3 数字图像处理

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4 通讯系统设计与仿真

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财务与金融工程

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二.MATLAB并行计算功能特点与硬件配置分解

随着科学计算的应用面扩大和深入,MATLAB的计算量越来越大,同时基于X86架构计算机多核并行计算技术成熟,MATLAB通过支持并行计算工具箱和分布式集群计算方式,完美借助多核架构的图形工作站和分布式集群的并行计算,大幅提升科学计算的效能。
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2.1 MATLAB的并行计算介绍

对工作站的并行计算支持

MATLAB利用 Parallel ComputingToolbox,可以使用多核处理器、GPU 以及计算机集群来解决运算和数据密集型问题。循环并行化 (parallel for-loops)、特殊数组类型以及并行数值算法等高级结构让您实现 MATLAB 应用程序的并行化,而无需进行 CUDA MPI 编程。可以使用 Simulink 工具箱并行运行一个模型的多个仿真。

工具箱提供用于在多核台式机上本地执行应用程序的12workerMATLAB 计算引擎)无需更改代码。

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对分布式集群并行科学计算支持

借助MATLABDistributed Computing Server在计算机集群或网格计算服务上运行同一个应用程序。此外,还可以交互式执行或在成批执行并行应用程序。
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主要功能

循环并行化 (parfor) - 用于在多处理器上并行运行任务的算法

支持启用了 CUDA NVIDIA GPU

可在一个多核桌面上本地运行十二个 worker

通过 MATLAB Distributed Computing Server 可支持计算机集群和网格

并行应用程序的交互和批量执行

分布式数组和单程序多数据 (spmd) 结构 - 用于大型数据集处理和数据并行算法

 

2.2工作站硬件配置与科学计算分解

矩阵式求解代数方程组过程中,矩阵规模的大小涉及到占用内存的多少,数据量和算法涉及到CPU的核数和频率,数据存储和读取对矩阵存储的硬盘I/O有要求,在很大程度上影响了计算的速度.是加速矩量法计算的关键,典型计算机配置的每一个配件对MATLAB性能有不同表现。

CPU---有更多CPU核心的计算机比和数量少的有更好的表现,但是结果随着MATLAB应用而不同,MATLAB自动使用多线程,在很多MATLAB应用中,以探索自然并行,但是不是所有MATLAB功能都是多线程的, 加速随着算法有所不同, 作为可选能力,Parallel Computing Toolbox提供并行程序结构,更多直接覆盖计算机多核,虚拟核很明显改善整个系统的性能,但是它对MATLAB应用的性能表现影响很小。

内存---内存容量在计算过程承载数据计算过程所有中间数据保存,如果存储容量不够,就会出现数据溢出,计算无法继续,不同数据量的求解对内存有一定要求,内存容量、CPU-内存通道数目、内存的频率都是对计算有影响的。

 硬盘---硬盘I/O带宽涉及数据读写和虚拟内存的性能,对于数据密集型计算和大型图像处理,硬盘容量和带宽极其重要。

 图卡---目前仅限支持Nvidia CUDA架构为主,MATLAB图形渲染靠的是CPU不是GPU,图卡主要负责正常的图形显示,以及支持GPU架构的并行计算应用,这种GPU并行计算主要是图像处理方面(需要安装ParallelComputing Toolbox

 

2.3工作站配置原则

1.内存配置:通常,矩阵计算的数据量和内存比例1:3,例如2GB数据,内存建议6GB以上。

2. CPU配置:内存确定后,一般和CPU核数比例是 4:1,例如:16GB内存以内,CPU用单颗4.

3. 图卡配置:如果是基于图像处理应用,最好提供支持1~4GPU计算,保证足够的数据量。

4. 硬盘配置:对于数据量规模小的应用,SATA接口就可以,如果数据量大,硬盘容量和转速相应提升,读写带宽也就越大,如数据量非常大,可以使用高速硬盘加高性能阵列,提升硬盘I/O带宽。


三.MATLAB科学计算工作站配置方案

Ultralab定制图形工作站是当今市场唯一能提供塔式、超级、机架、便携、特种等图形工作站全方面解决方案的品牌。拥有完整、完美、可靠、静音的高性能工作站全套产品系列,为行业用户在高性能计算、CAD/CAM/CAE、图形图像处理、虚拟仿真、三维动画、视频编辑等应用提供强劲、高效的定制专业级图形工作站。

Ultralab定制图形工作站将MATLAB应用软件结合最新计算机硬件技术,基于数据规模和软件应用特点划分配置方案,从而达到合理高效能完成科学计算。

科学计算工作站根据数据规模划分:

1.小规模科学计算解决方案

定位: 数据量在1~10GB以内规模, 支持4~8worker运算

从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

参考配置:

方案1 入门级图形工作站

提供四核CPU架构的计算解决方案
型号 UltraLAB H360/H370

硬件配置规格

No

类别

技术规格

 

机型

UltraLAB H360

UltraLAB H370

1

CPU

Intel第七代超高频处理器

(Kabylake架构)

4核4.8~5.2GHz

Intel第八代超高频处理器

(Coffelake架构)

6核4.7~5.0GHz

2

芯片组

Intel Z270+PCH

Intel Z370+PCH

3

内存槽/

通道数

最大容量

4根/双通道

双通道

64GB DDR4-2400

4根

双通道

64GB DDR4-2666

4

显卡

类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡

数量:最大2块,

接口:Pcie 16x 3.0

图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成

5

硬盘

5.1系统盘

类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB

类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB

5.2数据盘

类型1:SATA,数量5个,最大50TB

类型2:SAS,数量8个,支持32TB

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

平台

箱体:塔式(立式)

尺寸:深度553mm,宽度198mm,高度425mm 

电源:750w ,金牌

硬盘位:4个3.5”,3个5.25”

PCI扩展槽:2*PCIe 16X 3.0,1*PCIe 4X 3.0,3*PCIe 1X 3.0

IO端口:2个USB 3.0,4个USB 2.0,2个USB 3.1

intel千兆以太,8声道音频

前置输出端口:2个USB 2.0

8

硬件系统优化

(1)  CPU自动超频加速

(2)  高性能低延迟加速

9

扩展能力

(1)  CPU+GPU异构计算架构

(2)  图形生成架构

(3)  系统盘高io、高带宽架构

(4)  高io并行存储架构

10

显示器

可选,分辨率:高清、2K、4K

11

操作系统与虚拟系统

支持Windows7/8/10个人版

支持Windows Server 2008/2012/2016企业版

支持 Linux 全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等)

12

噪音控制

基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝

 

方案2 高性价比图形工作站

提供8~18CPU架构的计算解决方案

型号 UltraLAB H490

硬件配置规格:


类别

技术规格

1

CPU

Intel 第七代至尊处理器

(Kabylake-X架构)

数量 1颗,核数4~18个

选择1:8核4.8Ghz , 8MBL2缓存,11MBL3缓存

选择2:10核4.7Ghz, 10MBL2缓存,13.75MBL3缓存

选择3:12核4.6Ghz, 12MBL2缓存,16.5MBL3缓存

选择4:14核4.5Ghz, 14MBL2缓存,19.25MBL3缓存

选择5:16核4.5Ghz, 16MBL2缓存,22MBL3缓存

选择6:18核4.5Ghz, 18MBL2缓存,24.75MBL3缓存

2

芯片组

Intel X299+PCH

3

内存槽/

通道数

最大容量

8根

4通道

512GB DDR4-2666 Reg ECC

4

专业图卡

类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡

数量:最大5块,

接口:Pcie 16x 3.0

图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成

5

硬盘

5.1系统盘

类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB

类型2:SSD SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB

5.2数据盘

类型1:SATA,数量5个,最大50TB

类型2:SAS,数量8个,支持32TB

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

平台

箱体:塔式(立式)

尺寸: 深度525.3mm,宽度193mm,高度424mm

电源:865w ,金牌

硬盘位:4个3.5”,3个5.25”

PCI扩展槽:5*PCIe 16X

IO端口:2个USB 3.1G2,6个USB 3.1,intel千兆以太,8声道音频

前置端口:2个USB 2.0

8

硬件系统优化

(1)  CPU自动超频加速

(2)  高性能低延迟加速

9

扩展能力

(1)  CPU+GPU异构计算架构

(2)  图形生成架构

(3)  系统盘高io、高带宽架构

(4)  高io并行存储架构

10

显示器

可选,支分辨率:高清、2K、4K

11

操作系统

支持Windows7/8/10个人版

支持Windows Server 2008/2012/2016企业版

支持 Linux 全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等)

支持虚拟、私有云、共享图形服务系统

12

噪音控制

基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝

 

2.中等规模科学计算解决方案

定位于数据量在10~30GB以内科学计算规模, 支持8~12worker运算,支持GPU架构扩展

从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

参考配置:

方案3 全能型图形工作站

提供20~56CPU架构的计算解决方案

型号 UltraLAB EX620i

产品配置规格

No

类别

技术规格

1

CPU

型号:Xeon可扩展处理器系列

数量 2颗,核数20~56个

2

芯片组

Intel  C621+PCH

3

内存槽/

通道数

最大容量

16根

12通道

1TB DDR4-2666 Reg ECC

4

专业图卡

类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡

数量:最大4块,

接口:Pcie 16x 3.0

图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成

5

硬盘

5.1系统盘

类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB

类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB

5.2数据盘

类型1:SATA,数量8个,最大80TB

类型2:SSD,数量8个,支持32TB

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

平台

箱体:塔式、机架式两用

尺寸:深度648mm,宽度178mm,高度452mm

电源:1200w,金牌

硬盘位:8个3.5”热插拔,3个5.25”

PCI扩展槽:4*PCIe 16X,2*PCIe 8x

IO端口:2个USB 3.1,4个USB 3.1,2个USB 3.0,双intel千兆以太,8声道音频

前置端口:2个USB 2.0

8

硬件系统优化

(1)  CPU自动超频加速

(2)  高性能低延迟加速

(3)  高IO并行存储加速

9

扩展能力

(1)  CPU+GPU异构计算架构

(2)  系统盘高io、高带宽架构

10

显示器

可选,支持分辨率:高清、2K、4K

11

操作系统

支持Windows 7/8/10个人版

支持Windows Server 2008/2012/2016企业版

支持 Linux全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等)

支持虚拟、私有云、共享图形服务系统

12

噪音控制

基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝

 

方案4 图形图像型工作站

提供基于CPU+GPU架构的计算解决方案

型号 UltraLAB H610

产品配置规格

配备2颗最新intel  Haswell架构的Xeon E5 2600v4处理器、Nvidia 图卡、高I/O的企业级SSD,提供多种pcie 3.0 16x/8x/4x接口,配置规格:

No

类别

规格

1

CPU

2颗Xeon E5 2600v4系列(Broadwell-EP核心,最大44核)

支持自动超频加速, 最高频率达3.68Ghz

2

芯片组

Intel C612+PCH Chipset

3

内存

内存槽/最大容量:16根/512GB DDR4 2400 Reg ECC

4

硬盘

系统盘:M.2 4X接口,最大容量512GB,
SATA-SSD 6Gbps接口,最大容量2TB
数据盘:SATA 6Gbps接口,4个3.5”盘位,最大32TB
支持高速并行读写系统

5

专业图卡

Nvidia Quadro 或ATI Firepro全系列

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

网络端口

双千兆intel芯片,支持IO/AT加速,支持汇聚功能

8

扩展接口

分类

PCIe 16X 3.0

PCIe 8X 3.0

PCIe 4X 2.0

PCI-X

PCI

3

2

1

9

机箱电源

塔式,900W

10

显示器

可选

12

操作系统

支持Windows 2008、2012, Window7、8  32/64bits

支持 Redhat linux, Suse Linux 32/64bits等等

 

3.大规模科学计算解决方案

定位于数据量在30~70GB以内科学计算规模, 支持12worker运算,支持双GPU架构并行计算扩展,配备海量高速硬盘。

从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

参考配置:

方案5 超级图形工作站

提供基于超强CPU+GPU+I/O的计算解决方案

型号 UltraLAB Alpha720

Alpha720完美满足需要超多CPU核数、海量内存架构的高性能计算应用,为超大规模科学计算、有限元仿真、分子模拟计算、海量图像处理、大数据挖掘与分析、共享图形服务器系统等高端应用,海量数据级的超大规模科学与工程仿真、图像处理的超级图形工作站,同时具有绿色环境要求的静音、低辐射。

产品配置规格

No

类别

技术规格

1

CPU

Xeon E7 v3/ v4系列

数量 4颗,核数64、72个、96个,

支持CPU自动睿频加速, 最高频率达2.9Ghz

最高浮点计算速度3.8Tflops

2

芯片组

Intel  C602J+PCH(双QPI架构)

3

内存槽/

通道数

最大容量

32根

16通道

2TB DDR4-2133 Reg ECC

4

专业图卡

类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡

数量:最大2块,

接口:Pcie 16x 3.0

图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成

5

硬盘

5.1系统盘

类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB

类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB

5.2数据盘

类型1:SATA,数量16个,最大160TB

类型2:SSD,数量16个,支持64TB

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

平台

箱体:双塔式

尺寸:深度572mm,宽度405mm,高度628mm

电源:1700w,金牌

硬盘位:16个3.5”,3个5.25”

PCI扩展槽:2*PCIe 16X,2*PCIe 8x

IO端口:前置输出:4个USB 2.0,后置输出:3个USB 2.0,双intel千兆以太,8声道音频

8

硬件系统优化

(1)  CPU自动超频加速

(2)  高性能低延迟加速

(3)  高IO并行存储加速

9

扩展能力

(1)  CPU+GPU异构计算架构

(2)  系统盘高io、高带宽架构

10

显示器

可选,支持分辨率:高清、2K、4K

11

操作系统

支持Windows 7/8/10个人版

支持Windows Server 2008/2012/2016企业版

支持 Linux全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等)

支持虚拟、私有云、共享图形服务系统

12

噪音控制

基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝

 

 4. 超大规模科学计算解决方案

定位:数据量在100GB以上科学计算规模

 从MATLAB应用特点详解科学计算工作站硬件配置(依据数据规模大小划分)

参考配置:

方案6 超级科学与工程计算工作站

四颗Xeon E7 v4(最高96核、192线程)处理器、双GPU超算、双通道高速并行存储
配置规格

No

类别

技术规格

1

CPU

4颗Xeon E7 v3/v4系列(最高96核)

2

芯片组

Intel C602J+PCH Chipset

3

内存

内存槽:32根

最大容量:2TB DDR4 1866 Reg ECC

4

系统盘

系统盘:SATA-SSD 6Gbps或Pcie 4x接口,最大容量2TB

 

数据盘

海量高速并行存储系统(16个3.5”盘位,最大200TB,RAID5冗余)
主要特点:双通道,8GB缓存,io峰值双向20GB/s,和内存等速

5

专业图卡

专业图形显卡、GPU超算卡
数量:2块(双槽卡),接口:2*Pcie 16x 3.0
支持GPU图形生成
支持GPU超算(单精度8.7Glops双精度2.9Tflops)

6

光驱

DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机)

7

网络端口

双intel千兆/万兆以太芯片,支持IO/AT加速,支持汇聚功能

8

扩展接口

分类

PCIe 16X 3.0

PCIe 8X 3.0

PCIe 4X

PCI-X

PCI

 

2

 2

 

 

 

9

机箱电源

双塔式,1700W ,静音级

10

显示器

可选

11

键盘鼠标

可选

12

操作系统

支持Windows 2008 /2012 64bits

支持 Redhat linux, Suse Linux 64bits等等

 

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