mkfifo pe se && echo mkfifo success; #命名两个管道
gzip < pe > pe.gz &
gzip < se > pe.gz & #将管道文件压缩，后台运行
soap -a pair.1.fq.gz -b pair.2.fq.gz -D non-redundancy-1.fa.index -m 245 -x 445 -o pe -2 se -r 2 -l 30 -M 4 -p 4 -v 7 2>V1.UC59-4_110821.soap.pair.log && echo soap success; #运行程序
rm pe se && echo rmfifo success; #删除管道文件