参考:http://addls.com/mysql-innodb-%E4%B9%8B-ibdata1-%E7%98%A6%E8%BA%AB%E5%A4%A7%E6%B3%95.html
# 备份数据库：
/usr/local/mysql/bin/mysqldump -uDBuser -pPassword –quick –force –routines –add-drop-database –all-databases –add-drop-table > /data/bkup/mysqldump.sql
# 停止数据库
service mysqld stop
# 删除这些大文件
rm /usr/local/mysql/var/ibdata1
rm /usr/local/mysql/var/ib_logfile*
:> /usr/local/mysql/var/mysql-bin.index
# 手动删除除Mysql之外所有数据库文件夹，然后启动数据库
service mysqld start
# 还原数据
/usr/local/mysql/bin/mysql -uroot -phigkoo < /data/bkup/mysqldump.sql
默认情况下，innodb的参数设置的非常小，在生产环境中远远不够用
比如最重要的两个参数
innodb_buffer_pool_size 默认是8M
innodb_flush_logs_at_trx_commit 默认设置的是1 也就是同步刷新log(可以这么理解)
innodb_buffer_pool_size：这是InnoDB最重要的设置，对InnoDB性能有决定性的影响。默认的设置只有8M，所以默认的数据库设置下面InnoDB性能很差。在只有 InnoDB存储引擎的数据库服务器上面，可以设置60-80%的内存。更精确一点，在内存容量允许的情况下面设置比InnoDB tablespaces大10%的内存大小。
innodb_data_file_path：指定表数据和索引存储的空间，可以是一个或者多个文件。最后一个数据文件必须是自动扩充的，也只有最后一个文件允许自动扩充。这样，当空间用完后，自动扩充数据文件就会自动增长（以8MB为单位）以容纳额外的数据。例如： innodb_data_file_path=/disk1 /ibdata1:900M;/disk2/ibdata2:50M:autoextend两个数据文件放在不同的磁盘上。数据首先放在ibdata1 中，当达到900M以后，数据就放在ibdata2中。一旦达到50MB，ibdata2将以8MB为单位自动增长。如果磁盘满了，需要在另外的磁盘上面增加一个数据文件。
innodb_data_home_dir：放置表空间数据的目录，默认在mysql的数据目录，设置到和MySQL安装文件不同的分区可以提高性能。
innodb_log_file_size：该参数决定了recovery speed。太大的话recovery就会比较慢，太小了影响查询性能，一般取256M可以兼顾性能和recovery的速度
。
innodb_log_buffer_size：磁盘速度是很慢的，直接将log写道磁盘会影响InnoDB的性能，该参数设定了log buffer的大小，一般4M。如果有大的blob操作，可以适当增大。
innodb_flush_logs_at_trx_commit=2： 该参数设定了事务提交时内存中log信息的处理。
1) =1时，在每个事务提交时，日志缓冲被写到日志文件，对日志文件做到磁盘操作的刷新。Truly ACID。速度慢。
2) =2时，在每个事务提交时，日志缓冲被写到文件，但不对日志文件做到磁盘操作的刷新。只有操作系统崩溃或掉电才会删除最后一秒的事务，不然不会丢失事务。
3) =0时， 日志缓冲每秒一次地被写到日志文件，并且对日志文件做到磁盘操作的刷新。任何mysqld进程的崩溃会删除崩溃前最后一秒的事务
innodb_file_per_table：可以存储每个InnoDB表和它的索引在它自己的文件中。
transaction-isolation=READ-COMITTED: 如果应用程序可以运行在READ-COMMITED隔离级别，做此设定会有一定的性能提升。
innodb_flush_method： 设置InnoDB同步IO的方式：
1) Default – 使用fsync（）。
2) O_SYNC 以sync模式打开文件，通常比较慢。
3) O_DIRECT，在Linux上使用Direct IO。可以显著提高速度，特别是在RAID系统上。避免额外的数据复制和double buffering（mysql buffering 和OS buffering）。
innodb_thread_concurrency： InnoDB kernel最大的线程数。
1) 最少设置为(num_disks+num_cpus)*2。
2) 可以通过设置成1000来禁止这个限制