环境说明：
MySQL 5.6.16
OS:Linux RedHat 6.2 64bit
1.问题描述
目前新上一个使用MySQL数据库项目，在数据库中，每隔5分钟做truncate某个表操作，经常出现metadata lock锁等待，导致后面的对这个表的所有操作（包括读）全部metadata lock等待。严重影响了数据库运行。
且metadata lock锁等待不同于普通的行级锁，等待超时时间默认为365天，而普通的行级锁超时是120s
mysql> show variables like '%lock_wait%';
+--------------------------+----------+
| Variable_name | Value |
+--------------------------+----------+
| innodb_lock_wait_timeout | 120 |
| lock_wait_timeout | 31536000 |
+--------------------------+----------+
2 rows in set (0.00 sec)
因此如果metadata lock锁的源头不释放，则会一直阻塞，必须需要人为干预。
2.为什么需要Metadata lock
Metadata lock介绍：参考官方手册：http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/metadata-locking.html
MySQL 5.5.3 and up uses metadata locking to manage access to objects (tables, triggers, and so forth). Metadata locking is used to ensure data consistency but does involve some overhead, which increases as query volume increases. Metadata contention increases the more that multiple queries attempt to access the same objects.
参考MySQL bug989：http://bugs.mysql.com/bug.php?id=989
该bug是一个比较著名的问题：
我们知道，binlog内操作的记录是基于事务的提交顺序进行的，如果有一个事务未执行完成，而这个时候drop了表，这样在从库的执行顺序就会出现问题。
因此MySQL在5.5.3版本后引入了Metadata lock锁，事务释放后才会释放Metadata lock，这样在事务完成期间，是不能进行DDL操作的。
3.Metadata lock监控
当对表的DDL操作很慢的时候，可以通过如下方法查看当前是否是在等待Metadata lock：
mysql> select * from information_schema.processlist where state = 'Waiting for table metadata lock';
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+--------------------------+
| ID | USER | HOST | DB | COMMAND | TIME | STATE | INFO |
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+--------------------------+
| 7 | root | localhost | NULL | Query | 56 | Waiting for table metadata lock | truncate table baofeng.a |
| 9 | root | localhost | NULL | Query | 4 | Waiting for table metadata lock | select * from baofeng.a |
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+--------------------------+
2 rows in set (0.00 sec)
其中线程ID为7的truncate被其他事务阻塞，而线程ID为9的被truncate table阻塞，因此该查询主要看哪个会话在做DDL操作，其他的会话的state为metadata lock均为被该DDL阻塞。
那么问题来了，怎么去判断DDL被什么锁住了？
这个从目前来看比较困难，不能直观的去判断，网上有人做了一个插件可以实现（在MariaDB 10中默认已提供类似功能）：
[root@mysql-db101 tmp]# tar -xzvf mysql-5.6.16.tar.gz
[root@mysql-db101 tmp]# unzip mysql-plugin-mdl-info-master.zip
[root@mysql-db101 tmp]# cp -r ./mysql-plugin-mdl-info-master/src ./mysql-5.6.16/plugin/mdl_info
[root@mysql-db101 tmp]# cd ./mysql-5.6.16
[root@mysql-db101 mysql-5.6.16]# cmake \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/mysql/mysql \
-DMYSQL_DATADIR=/home/mysql/data \
-DMYSQL_TCP_PORT=3306
#注意，mysql是以源代码编译出的debug版本，那编译插件的时候不要加 -DBUILD_CONFIG=mysql_release
[root@mysql-db101 mysql-5.6.16]# cd plugin/mdl_info/
[root@mysql-db101 mdl_info]# make
[root@mysql-db101 mdl_info]# make install
mysql> INSTALL PLUGIN MDL_LOCKS SONAME 'mdl_info.so';
ERROR 1127 (HY000): Can't find symbol 'MDL_LOCKS' in library
mysql>
mysql>
mysql> show variables like '%plugin%';
+---------------+-------------------------------+
| Variable_name | Value |
+---------------+-------------------------------+
| plugin_dir | /home/mysql/mysql/lib/plugin/ |
+---------------+-------------------------------+
1 row in set (0.00 sec)
mysql> INSTALL PLUGIN MDL_info SONAME 'mdl_info.so';
Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)
#这里plugin_name为MDL_INFO，而非文档中说的MDL_LOCKS
mysql> select * from information_schema.mdl_info;
+-----------+-------------+---------------------+-----------+----------+------+
| THREAD_ID | DURATION | TYPE | NAMESPACE | DATABASE | NAME |
+-----------+-------------+---------------------+-----------+----------+------+
| 6 | TRANSACTION | SHARED_READ | TABLE | baofeng | a |
| 7 | STATEMENT | INTENTION_EXCLUSIVE | GLOBAL | | |
| 7 | TRANSACTION | INTENTION_EXCLUSIVE | SCHEMA | baofeng | |
+-----------+-------------+---------------------+-----------+----------+------+
3 rows in set (0.00 sec)
这里可以看到线程6阻塞了线程7的truncate操作
通过如下语句查看相应的会话情况：
mysql> select
-> a.*,b.user,b.host,b.command,b.time,b.state,b.info
-> from
-> information_schema.mdl_info a,
-> information_schema.PROCESSLIST b
-> where
-> a.thread_id = b.id\G;
*************************** 1. row ***************************
THREAD_ID: 6
DURATION: TRANSACTION
TYPE: SHARED_READ
NAMESPACE: TABLE
DATABASE: baofeng
NAME: a
user: root
host: localhost
command: Sleep
time: 1035
state:
info: NULL
*************************** 2. row ***************************
THREAD_ID: 7
DURATION: STATEMENT
TYPE: INTENTION_EXCLUSIVE
NAMESPACE: GLOBAL
DATABASE:
NAME:
user: root
host: localhost
command: Query
time: 990
state: Waiting for table metadata lock
info: truncate table baofeng.a
*************************** 3. row ***************************
THREAD_ID: 7
DURATION: TRANSACTION
TYPE: INTENTION_EXCLUSIVE
NAMESPACE: SCHEMA
DATABASE: baofeng
NAME:
user: root
host: localhost
command: Query
time: 990
state: Waiting for table metadata lock
info: truncate table baofeng.a
3 rows in set (0.00 sec)
ERROR:
No query specified
4.导致Metadata Lock的场景
场景1：
会话1正在对表a进行DML操作（包括query），这个时候会话2执行DDL操作，需要获取metadata独占锁，因此等待会话1。
这个时候可以通过show processlist能查看该会话（该会话的state不会waiting for table metadata lock）
场景2：
会话1对表a进行DML（包括query）事务操作后，没有commit/rollback，这个时候show processlist是看到的只是会话处于sleep状态，执行的SQL显示为空。而这个时候会话2执行DDL操作，同样获取不到metadata独占锁，就会等待。可以通过查询系统事务表有体现：
mysql> select * from information_schema.innodb_trx\G;
*************************** 1. row ***************************
trx_id: 11134
trx_state: RUNNING
trx_started: 2014-12-23 10:23:44
trx_requested_lock_id: NULL
trx_wait_started: NULL
trx_weight: 0
trx_mysql_thread_id: 9
trx_query: NULL
trx_operation_state: NULL
trx_tables_in_use: 0
trx_tables_locked: 0
trx_lock_structs: 0
trx_lock_memory_bytes: 360
trx_rows_locked: 0
trx_rows_modified: 0
trx_concurrency_tickets: 0
trx_isolation_level: READ COMMITTED
trx_unique_checks: 1
trx_foreign_key_checks: 1
trx_last_foreign_key_error: NULL
trx_adaptive_hash_latched: 0
trx_adaptive_hash_timeout: 10000
trx_is_read_only: 0
trx_autocommit_non_locking: 0
1 row in set (0.00 sec)
ERROR:
No query specified
但是如果事务很多，则没办法判断是哪个会话导致。
该场景最为普遍，而且是最频发，后面重点会对该场景进行测试。
场景3：
通过show processlist看不到表A上有任何操作，在information_schema.innodb_trx中也没有任何进行中的事务。这很可能是因为在一个显式的事务中，对表A进行了一个失败的操作（比如查询了一个不存在的字段），这时事务没有开始，但是失败语句获取到的锁依然有效。从performance_schema.events_statements_current表中可以查到失败的语句。
官方手册上对此的说明如下：
If the server acquires metadata locks for a statement that is syntactically valid but fails during execution, it does not release the locks early. Lock release is still deferred to the end of the transaction because the failed statement is written to the binary log and the locks protect log consistency.
也就是说除了语法错误，其他错误语句获取到的锁在这个事务提交或回滚之前，仍然不会释放掉。because the failed statement is written to the binary log and the locks protect log consistency 但是解释这一行为的原因很难理解，因为错误的语句根本不会被记录到二进制日志
5.如何快速处理Metadata lock
如果是手工执行的DDL操作，例如加字段、drop表等，可以手工Cancel，先查找对当前该表是否在执行长事务操作，或者有未提交事务。确认没问题后再执行DDL操作。
如果是应用程序中执行的DDL操作，例如truncate，这个时候没办法调整应用，则可以利用MDL插件，去查询当前的DDL被哪个会话阻塞，kill掉该会话线程。这个方法前提是需要安装MDL插件，目前我们的环境还都没有安装。
6.如何避免Metadata Lock
6.1.关注autocommit
autocommit分成2个层次：
- 数据库autocommit
- 客户端工具的autocommit
MySQL默认的autocommit为1，即自动提交，这种方式不太安全，因为事务默认不受人为控制，因此建议关闭autocommit。咨询了支付宝的MySQL DBA，支付宝的MySQL的autocommit全部是关闭的。
客户端工具分为2种，一种是继承数据库的autocommit模式，例如SQLyog、Mysql命令行接口；还有一种是自己独立的autocommit，例如MySQL workbench，设置工具本身的autocommit，而无视数据库层面autocommit。
无论是开发还是维护，一定要弄清楚自己的客户端的autocommit模式。
无论是使用哪种客户端工具，首先要弄清楚当前环境下的autocommit方式是什么，如果不是autocommit，一定要确保所有的操作都需要显示的commit/rollback，否则即使是select查询某个表，甚至是语义（select一个错误的字段）报错，也会造成对其他会话对该表的DDL的metadata lock等待。
6.2.开发中注意事项
1、首先要确认驱动中的autocommit级别，例如JDBC中，默认conn.setAutoCommit()=true，
当在该模式下，无论做select还是DML操作，均会自动提交，不会造成应用阻塞DDL操作。
2、当我们需要开启事务，设置conn.setAutoCommit(false)，任何SQL操作（包括读）操作后 需要显式的调用conn.commit()，或者事务完成后conn.setAutoCommit(true)开启默认自动提交，才会释放元数据锁。
3、注意SQL执行后，一定要确保在很短的时间内显式commit/rollback或者conn.setAutoCommit(true)
做了相关测试，数据库的autocommit参数的设置结果，与应用中的conn.setAutoCommit(false/true)没有任何关系。