首先这里所描述的过程适用于所有平台的MySQL。5.7.6之前，使用mysql_install_db在UNIX和类UNIX系统。MySQL 5.7.7之前，Windows分布包括了在MySQL数据库建表的数据目录。
以下说明假定您当前的位置是MySQL的安装目录，这里以BASEDIR为例
1 shell> cd BASEDIR
要初始化数据目录，调用 mysqld的与 --initialize或 --initialize不安全的选项，这取决于你是否希望服务器生成的一个随机初始密码'root'@'本地账号'的账户。
在Windows环境下，使用这些命令：
1 C:\> bin\mysqld --initialize
2 C:\> bin\mysqld --initialize-insecure
在Unix和类Unix系统，重要的是要确保数据库的目录和文件都是由拥有 MySQL的登录帐户，以便服务器具有读写访问它们，当你以后运行它。为了确保这一点，如果你运行的mysqld为root，包括 --user选项，如下所示：
1 shell> bin/mysqld --initialize --user=mysql
2 shell> bin/mysqld --initialize-insecure --user=mysql
否则，执行程序，而身份登录mysql的，在这种情况下可以省略 --user从命令选项。
无论任何平台，使用 --initialize为“ 默认安全 ”的安装（即包括产生一个随机的初始根密码）。在这种情况下，密码被标记为过期，你需要选择一个新的密码。随着 --initialize-insecure 的选项，没有root口令生成; 假设你把服务器投入使用之前指定一个密码及时查询账户。
如果mysqld的没有标识的安装目录或数据目录的正确位置.它可能需要指定其他选项，如 --basedir或 --datadir.如果mysqld的没有标识的安装目录或数据目录的正确位置。例如（输入在一行上的命令）：
1 shell> bin/mysqld --initialize --user=mysql
2 --basedir=/opt/mysql/mysql
3 --datadir=/opt/mysql/mysql/data
另外，对于Unix和类Unix系统，假设选择文件名是 /opt/mysql/mysql/etc/my.cnf。把相关的选项设置中的选项文件和传递文件命名为 mysqld的。把文件中的这几行：
1 [mysqld]
2 basedir=/opt/mysql/mysql
3 datadir=/opt/mysql/mysql/data
然后调用mysqld，如下（输入上的一行命令 -- --defaults-file第一个选项）：
1 shell> bin/mysqld --defaults-file=/opt/mysql/mysql/etc/my.cnf
2 --initialize --user=mysql
在Windows中，假设C：\ my.ini中包含这些命令：
1 [mysqld]
2 basedir=C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.7
3 datadir=D:\\MySQLdata
然后调用mysqld.如下（--defaults-file必须是第一个选项）
1 C:\> bin/mysqld --defaults-file=C:\my.ini --initialize
当调用的 --initialize或 --initialize-insecure选项 ，mysqld执行下面的初始化程序。
注意
服务器写入的任何消息，以它的标准错误输出。这可能会被重定向到错误日志.
服务器会检查数据目录，如下所示的存在：
如果没有数据目录存在，则服务器将创建它。
如果数据目录存在并且不为空（即，它包含文件或子目录），产生一个错误消息后在服务器退出：
1 [ERROR] --initialize specified but the data directory exists. Aborting.
1.在这种情况下，删除或重命名数据目录，然后重试。
在MySQL 5.7.11中，现有的数据目录允许非空，如果每个条目或者具有开头一段的名称（.），请使用名为--ignore-db-dir 设置。
2.在数据目录中，服务器创建 的mysql系统数据库及其表，其中包括授权表，服务器端帮助表，时区表。
3.服务器初始化system tablespace 和管理所需的相关数据结构的InnoDB表。
注意
经过mysqld的设置了 InnoDB的system tablespace，改变一些表空间的特性需要建立一个全新的实例。这包括在system tablespace的第一个文件，撤销日志的数量的文件名 ??。在配置文件运行前的mysqld。如果你不想使用默认值，请确保该设置innodb_data_file_path中 和innodb_log_file_size 参数配置到位.同时一定要指定影响的创建和位置需要其他参数 InnoDB的文件，如 innodb_data_home_dir和 innodb_log_group_home_dir。
如果这些选项在您的配置文件中文，但该文件是不是在MySQL的读取默认的位置，使用指定文件位置 --defaults-extra-file设置.
4.服务器创建一个'root'@'localhost'的超级用户帐户。对于该帐号的密码，服务器的操作取决于你如何调用它：
-- 当用 --initialize账户而不用--initialize-insecure账户时。服务器生成一个随机的密码，将其标记为已过期，并写入显示密码的消息：
1 [Warning] A temporary password is generated for root@localhost:
2 iTag*AfrH5ej
-- 当用 --initialize-insecure账户时候。服务器不会生成一个密码，会将其标记为过期，并写入一条警告消息：
1 Warning] root@localhost is created with an empty password ! Please
2 consider switching off the --initialize-insecure option.
5.如果--init-file选项被给出以命名的SQL语句的文件时，服务器执行文件中的语句。可以进行自定义的引导序列。
服务器工作在引导方式，一些功能是不可用，限制在文件中所允许的语句。这些措施包括，涉及到账户管理（如报表CREATE USER或 GRANT），复制和标识符。
6.然后退出服务器
当您通过启动服务器初始化数据目录--initialize或--initialize-insecure，正常启动的服务器（也就是没有任何的这些选项），并指定'root'@'localhost'的一个新密码：
---启动服务器。
---链接到服务器..
如果你使用--initialize 但不使用--initialize-insecure初始化数据目录，连接到服务器的 根目录使用的随机密码，服务器初始化过程中产生的：
1 shell> mysql -u root -p
2 Enter password: (enter the random root password here)
如果您不知道该密码，查看服务器错误日志。
如果你使用--initialize-insecure初始化数据目录连接到服务器的root没有密码：
1 shell> mysql -u root --skip-password
---连接后，会分配一个新的root密码：
1 mysql> ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'new_password';
注意
由服务器执行的数据目录初始化序列不能代替被执行的操作 mysql_secure_installation或 mysql_ssl_rsa_setup。