【文件属性】：
文件名称：siftr:预测突变对蛋白质功能的影响
文件大小：98KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-12 19:07:16
R
预测突变对蛋白质功能的影响
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安装
要安装siftr，请首先确保您的R版本至少为R 3.0。 您可以通过在R控制台中键入以下内容进行检查：
R.Version() $ major
安装并加载devtools软件包：
install.packages( " devtools " )
library( " devtools " )
从github下载并安装siftr软件包：
install_github( " omarwagih/siftr " )
装入siftr包装
library( " siftr " )
在样本数据上运行siftr
# Get the path to the sample amino acid alignment
# Alternati
【文件预览】：
siftr-master
----.DS_Store(12KB)
----NAMESPACE(319B)
----DESCRIPTION(453B)
----inst()
--------.DS_Store(8KB)
--------extdata()
----R()
--------siftr-main.r(8KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------siftr-helper.r(15KB)
----build()
--------build_siftr.r(734B)
--------siftr_1.0.0.tar.gz(42KB)
----README.md(2KB)
----man()
--------pbWeightsNorm.Rd(747B)
--------summary.siftr_matrix.Rd(363B)
--------.DS_Store(6KB)
--------checkUnequalSequenceLengths.Rd(549B)
--------positionInfoContent.Rd(873B)
--------infoContent.Rd(262B)
--------normalizeWeights.Rd(466B)
--------filterPredictions.Rd(1KB)
--------infoContent.siftr_matrix.Rd(432B)
--------pseudo_diri.Rd(578B)
--------getEpsilonValues.Rd(466B)
--------.Rhistory(38B)
--------makeSiftMatrix.Rd(639B)
--------removeIdenticalSeqs.Rd(486B)
--------diffAA.Rd(247B)
--------percentIdentity.Rd(433B)
--------medianInfoContent.Rd(608B)
--------diffAA.siftr_matrix.Rd(447B)
--------predictFromAlignment.Rd(866B)
--------makePWM.Rd(658B)
--------addLogs.Rd(339B)
--------print.siftr_matrix.Rd(412B)
--------show.siftr_matrix.Rd(289B)
--------pbWeights.Rd(654B)
--------medianOfArray.Rd(407B)
--------letterMatrix.Rd(667B)