【文件属性】：
文件名称：SatIntExt:卫星内部和外部Illumina读数的分析
文件大小：40KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-07 06:21:50
SatIntExt
卫星内部和外部Illumina读数的分析
提取重复元素的内部和外部读取对的协议
内部读取对：两个成员都与同一重复元素具有同源性。 它们应该位于satDNA阵列内。
外部读对：一个与重复元件同源的成员，另一个与另一个重复元件同源的成员。 一个读数应该位于satDNA阵列内部，而另一个读数应该位于satDNA阵列外部。
0.随机读取
带有读操作的FASTA文件应混洗。 您可以使用：
$ shuffleSequences_fasta.pl file_1.fasta file_2.fasta file_12.fasta
一种替代方法是使用：
$ rexp_prepare_normaltag.py
FASTA文件应如下所示：
>seq1/1
AAAAAA
>seq1/2
AAAAAA
>seq2/1
AAAAAA
>seq2/2
AAAAAA
[...]
【文件预览】：
SatIntExt-main
----internal_external_read_pairs.png(41KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(962B)