【文件属性】：
文件名称：TIPS：路径重要性的轨迹推断的简化方法
文件大小：1.18MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-12 23:59:50
R
尖端
通过伪时比较对单细胞RNAseq数据进行功能评估的途径意义的轨迹推断
直接从R和GitHub启动TIPS
步骤1：安装R和RStudio
在运行TIPS之前，您将需要安装R和RStudio。请检查CRAN（ ）以安装R。请检查以获取有关R的信息。安装RStudio。
步骤2：安装所需的软件包
使用RStudio启动R会话并运行以下行：
install.packages(c("shiny","shinydashboard","markdown","ggplot2","Seurat","kohonen","viridis"))
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(c("monocle","switc
【文件预览】：
TIPS-master
----base()
--------share.R(894B)
--------ui_intro.R(706B)
--------gdata.R(19KB)
--------ui_gdata.R(36KB)
----global.R(238B)
----ui.R(2KB)
----data()
--------TFs_msigdb.gmt(1.03MB)
--------lung_phenotype_data.rds(16KB)
--------Hallmarks_msigdb.gmt(47KB)
--------lung_exprs_data.csv(369KB)
--------Pathways_KEGG.gmt(96KB)
--------Pathways_Reactome.gmt(791KB)
--------EnrichedmicroRNA_msigdb.gmt(229KB)
--------ss.gmt(3KB)
--------Pathways_Biocarta.gmt(46KB)
--------gene_set.rds(2KB)
--------lung_exprs_data.rds(162KB)
--------lung_phenotype_data.csv(69KB)
----intro.md(1KB)
----test.R(1KB)
----server.R(258B)
----README.md(2KB)