【文件属性】：
文件名称：matlab自相关代码-simplified_mhci_model_mcmc:MCMC采样器可推断MHC-I表示的简化模型
文件大小：1.08MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-23 15:12:56
系统开源
matlab自相关代码该MATLAB脚本集合可用于推断I类MHC肽呈递的简单模型的参数。参数推断基于细胞内肽水平和细胞表面表位水平的实验时程测量。
示例数据集包含在文件all_Kb_tryptic.csv（细胞内水平；缩放为最大值1）和all_Kb_epitope.csv（细胞表面水平；每个细胞的绝对拷贝数）中。
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结果
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结果将保存到“结果”文件夹并从中加载。
包含示例结果文件（example_results.mat）。
通常，将为结果提供一个包含写入时间和日期的文件名。
*****简化模型_both_infer.m
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要运行推断，请运行simple_model_both_infer.m。该脚本也是您可以在其中选择数据文件，后续肽段的数量，老化和采样迭代的数量以及采样器的初始状态和步长的方法。
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gibbs_sampler.m
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gibbs_sampler.m包含MCMC采样器。
*****简化的模型.m
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有关细胞内肽和细胞表面表
【文件预览】：
simplified_mhci_model_mcmc-master
----LL.m(803B)
----simplified_model_both_infer.m(2KB)
----all_Kb_tryptic.csv(376B)
----all_Kb_epitope.csv(244B)
----.DS_Store(6KB)
----simplified_model.m(2KB)
----Results()
--------example_results.mat(1.07MB)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(3KB)
----plot_results.m(2KB)
----gibbs_sampler.m(8KB)