【文件属性】:
文件名称:scriptmanager
文件大小:21.43MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-14 04:53:05
bioinformatics ngs-analysis Java
脚本管理员
包含有用的NGS分析脚本的GUI管道。
脚本通常在半描述性选项卡中进行分类,并设计为可以彼此并行运行。
使用ScriptManager的基本绘图功能的教程
打开根目录中可用的ScriptManager-Tutorial.docx
制作说明
(克隆此存储库后):
> cd scriptmanager
> ./gradlew build
编译后的JAR文件将输出到build/libs目录中。
当前可用的脚本(210106):
BAM统计:
-BAM统计
对对数统计
-BAM基因组相关
BAM操作:
-BAM-BAI索引器
-BAM文件分类器
-BAM删除重复项
-BAM复制合并
-PIP-seq过滤器
BAM格式转换器:
-BAM到scIDX
-BAM到GFF
-BAM到BED
-BAM到bedGraph
文件实用程序:
-MD5校验和
高峰通话:
-基因