【文件属性】：
文件名称：RNAlysis:RNA测序分析流程
文件大小：10.6MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-17 09:53:07
bioinformatics rna-seq bioinformatics-pipeline rnaseq transcriptomics
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什么是RNA裂解？
RNAlysis是一个python软件包，提供用于RNA测序数据的模块化分析管道。 该软件包包括各种过滤方法，数据可视化，聚类分析，富集分析和探索性分析。
RNA分解使您可以按任意顺序执行过滤和分析。 它具有在任何给定阶段保存或加载进度的功能，并可以在保存的文件名中记录您执行的操作顺序。
RNA分解通常与测序计数矩阵和差异表达输出文件一起使用，并且特别与python的HTSeq-count和R的DESeq2集成。
主要特点
通常，过滤您的读取计数矩阵，倍数变化数据，差异表达表和表格数据。
归一化您的读取计数数据
可视化，探索和描述您的测序数据
通过聚类和降维发现样本表达谱之间的全局关系
创建和共享分析管道
使用预定的基因本体术语或使用的已定义属性执行富集分析
依存关系
麻木
大熊猫
科学的
matplotlib
海生的
组织富集分析