BLAST:BLAST算法

时间:2021-06-16 05:19:56
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文件名称:BLAST:BLAST算法
文件大小:112KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-16 05:19:56
C 序列对齐 C 中的 Smith-Waterman 和 Needleman-Wunsch 对齐 关于 最佳局部(Smith-Waterman)和全局(Needleman-Wunsch)对齐算法的C实现。 编写快速,便携且易于使用。 命令行实用程序smith_waterman和needleman_wunsch提供了极大的灵活性。 代码也可以很容易地包含在第三方程序中,有关示例,请参见nw_example/和sw_example/目录。 还包括 perl 模块,为程序提供 perl API。 特征: 对齐任何一对 ASCII 序列(DNA、蛋白质、单词等) 指定比对评分系统或选择一个通用评分系统(BLOSUM 等) 指定与给定分数匹配任何字符的通配符 对齐--nomismatches匹配 ( --nomismatches ),或无间隙 ( --nogaps ) 与局部和全局对齐。 当两者

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