R语言中使用subset函数对数据进行分类管理操作

时间:2024-03-15 10:43:35

我们在SCI论文中常常可以见到这样的表格,是根据分类来做出统计结果的,如下图,是根据患者是否存活把患者分成了两类幸存的和死亡的做分别统计,然后得出各类统计结果
R语言中使用subset函数对数据进行分类管理操作
那么,R语言是怎么做出这样的表格呢?首先我们要把数据进行分割,得到一个幸存的数据表和一个死亡的数据表,然后再分别统计,我们今天利用R语言自带的subset函数来演示这一功能,这是一个非常重要的功能,为今后我们对数据进一步分析做准备。
我们使用SPSS自带的一个Breast cancer survival肿瘤数据来演示,首先我们把这个数据导入R,并且删除缺失值
library(foreign)
library(survival)
bc <- read.spss(“E:/r/Breast cancer survival agec.sav”,
use.value.labels=F, to.data.frame=T)
bc <- na.omit(bc)
R语言中使用subset函数对数据进行分类管理操作
查看一下bc这个数据集的结构
head(bc)
R语言中使用subset函数对数据进行分类管理操作
age表示年龄,pathsize表示病理肿瘤大小(厘米),lnpos表示腋窝淋巴结阳性,histgrad表示病理组织学等级,er表示雌激素受体状态,pr表示孕激素受体状态,status结局事件是否死亡,pathscat表示病理肿瘤大小类别(分组变量),ln_yesno表示是否有淋巴结肿大,time是生存时间,后面的agec是我们自己设定的,不用管它。
在英文中subset就是亚组和子集的意思,R语言中subset函数就是用来构造子集的,我们使用这个功能来对数据进行分组。Subset函数使用最少要指定两个指标,一个是数据集,一个是变量。ln_yesno只有两个变量0和1,0表示没有淋巴结肿大,1表示有淋巴结肿大,我们现在使用ln_yesno这个指标把患者分成两组,一组是由淋巴结肿大的,一组是没有淋巴结肿大的。
ln_yesno0<-subset(bc,bc$ln_yesno<1)#我们告诉subset 函数在ln_yesno这个变量中取值为小于1的指标,也就是0
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同理输入
ln_yesno1<-subset(bc,bc$ln_yesno>=1)
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这样就得到了两个数据框ln_yesno0和ln_yesno1分别代表一组是由淋巴结肿大的,一组是没有淋巴结肿大的。说了一大堆,其实代码就是几行,非常简单。
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