【R语言学习笔记】RGraphviz包的安装与加载方法

时间:2022-03-09 16:55:23

      最近学习一个算法,是用R语言实现的,其中需要用到RGraphviz,我原先想按照以前安装包的方法:在镜像中找到就可以直接点击、安装该包。可是我找遍了不同地区的一些镜像,都找不到我想要安装的包。所以我查找资料,试了很多方法,最后成功了,故作此分享与总结。

1、安装版本

      目前的Rgraphviz必须安装graphviz2.20:http://www.graphviz.org/pub/graphviz/stable/windows/
      选择:graphviz-2.20.3a.msi  下载并根据提示安装,保存到D: 路径下

2、修改环境变量

      安装graphviz-2.20.3a.msi之后需要更改环境变量(此步骤可以参考解决方法:https://wiki.duke.edu/display/DUKER/Install+RGraphviz+under+Windows):

 (1)新增以下用户变量

GRAPHVIZ_INSTALL_DIR     值设置为:D:\Graphviz2.20  (这个值需要根据你的实际情况,修改成graphviz的安装路径)

GRAPHVIZ_INSTALL_MAJOR   值设置为:2

GRAPHVIZ_INSTALL_MINOR    值设置为:20

 (2)修改系统变量

Path 中的值新增:   D:\Graphviz2.20\bin;  (这个值需要根据你的实际情况,修改成graphviz的安装路径下bin文件所在的文件夹)

3、在R中安装Rgraphviz

输入以下语句:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("Rgraphviz")

4、在R中输入      library("RGraphviz")

出现以下语句则说明安装成功:(“Rgraphviz”包的安装会自动安装关联的包“BiocGenerics”和“graph”)

package ‘BiocGenerics’ successfully unpacked and MD5 sums checked
package ‘graph’ successfully unpacked and MD5 sums checked
package ‘Rgraphviz’ successfully unpacked and MD5 sums checked

到目前为止,Rgraphviz就安装成功啦~