文件名称：GenomeAnalysis
文件大小：22KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-03 07:44:08
Shell
基因组分析 项目目标 该项目的目的是从复制一些结果。 我不会分析整个基因组，而是只关注支架10。 方法 项目期间将使用各种分析。 它们是用于DNA装配的Canu，Pilon和RepeatMaker，用于RNA装配的Trinity，用于注释和BRAW的BRAKER，以及STAR将用作比对器。 时间轴（来自学生手册检查点） 为了按计划进行，基因组组装应在4月15日完成，注释应在4月29日完成，而RNA作图应在5月4日完成。 资料组织 文件和简要概述了我如何组织文件。 我不知道需要多少空间，因此计划是尽可能长时间地压缩文件，并对原始数据使用软链接以节省空间。 项目中使用的所有文件都将存储在我的UPPMAX文件夹中。 这个git仓库将包含除数据之外的所有文件。 项目中使用的文件将具有许多不同的文件格式，例如fasta和fastq文件。 日志 到目前为止我所做的概述。 检索元数据和原始数据 我在搜
【文件预览】：
GenomeAnalysis-main
----data_organisation.txt(885B)
----data_organisation.png(18KB)
----analysis()
--------genome_assembly()
----code()
--------misc(278B)
--------retrieve_data(760B)
--------genome_assembly.sh(524B)
----README.md(3KB)